刘小泽写于2020.6.8从https://github.com/kevinblighe/E-MTAB-6141这...[作者空间]
刘小泽写于2020.5.29这篇文章做了一件事,就是帮助我们区分不同的批次矫正方法,然后比较了一下优劣 文章题目:...[作者空间]
刘小泽写于2020.3.19偶然看到大佬又在推荐精品资源,于是进去看了看,确实写得很走心,和你分享可以详细学习学习...[作者空间]
什么是桑基图 桑基图(Sankey diagram),即桑基能量分流图,也叫桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程...[作者空间]
原文链接: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC607288...[作者空间]
我的单细胞测序project主要是做炎症相关的单细胞转录分析,在检索paper的过程中,发现有关单细胞测序和病毒相...[作者空间]
前情回顾:让你的单细胞数据动起来!|iCellR(一)在上文我们已经基本完成了聚类分析和细胞在不同条件下的比例分析...[作者空间]
https://www.nature.com/articles/s41597-019-0351-8 NGS系列文章...[作者空间]
Single-Cell RNA-Seq Technologies and Related Computationa...[作者空间]
0. 简介 这篇文章是2019年发表在Nature Communications上的使用自编码器对单细胞RNA-S...[作者空间]
越来越多的同学开始自己尝试做10X单细胞转录组数据分析了,除了Linux的基本命令之外,首先用到的软件是cellr...[作者空间]
刘小泽写于19.8.21+28这次花费的时间较长,个人感觉这个包比Seurat、Scater难学,说明文档写的实在...[作者空间]
SeuratData是一种使用R的内部包和数据管理系统以Seurat对象的形式分发数据集的机制。它代表了一种方便用...[作者空间]
刘小泽写于19.8.9-第三单元第五讲:利用scRNAseq包学习scater笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录...[作者空间]
刘小泽写于19.8.8-第三单元前四讲:学习scRNAseq这个R包笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探索...[作者空间]
刘小泽写于19.8.7-第二单元最后一讲:差异分析及KEGG注释简介笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探索...[作者空间]
单个细胞类型的识别是多细胞样品研究的基础。单细胞RNAseq技术允许对单个细胞进行高通量的表达分析,极大地提高了我...[作者空间]
我们发现在loupe种一个细胞群的红色基因(log2 fold-change)基本在一起,那么它是如何做对的呢? ...[作者空间]
刘小泽写于19.7.18+28官方总共有7个数据集,涵盖了新版本的不同亮点这一次跟着教程https://satij...[作者空间]
The new release of Cell Ranger offers new functionality a...[作者空间]