在单细胞数据分析中，在确定细胞类型后，除了可以进行差异表达基因分析外，还可以针对单个细胞类型进行分析特定分析，这时...[作者空间]
最近一直在学习单细胞方面的知识，无意中看到别人的帖子在分享如何画堆叠的小提琴图(StackedVlnPlot)...[作者空间]
刘小泽写于2020.6.8从https://github.com/kevinblighe/E-MTAB-6141这...[作者空间]
1. 参考资料 https://mp.weixin.qq.com/s/ybr1rK5CcC-BfDKUYxKcNw...[作者空间]
在做单细胞转录组数据分析的时候，获得分群后我们希望知道每个群的marker基因是什么以此来描述细胞群的特征。其技术...[作者空间]
安装相关： 在服务器上安装SCopeLoomR时，输入如下 devtools::install_github("a...[作者空间]
这是ggplot2可视化专题的第一个实例操作 ggplot2的基本思路见前文总论：基于ggplot2的RNA-se...[作者空间]
简介 柱状图一般用于，当我们都有一组分类变量以及每个类别的定量值，而我们关注的主要重点是定量值的大小时。 应该在柱...[作者空间]
刘小泽写于19.12.3-5朋友们，我又回来啦！继续奏响单细胞交响乐！内容来自：https://osca.bioc...[作者空间]
在过去的几年里，分析scRNA-seq的方法数量激增，现在有超过200个可用的软件工具。每个工具都需要选择如何存储...[作者空间]
实用Seurat自带的热图函数DoHeatmap绘制的热图，感觉有点不上档次，于是我尝试使用ComplexHeat...[作者空间]
本文介绍了单细胞数据分析中一个分析点：如何消除混杂因素？ 何为混杂因素（confounding factors） ...[作者空间]
编者按：本文介绍了新版Seurat在数据可视化方面的新功能。主要是进一步加强与ggplot2语法的兼容性，支持交互...[作者空间]
刘小泽写于19.9.13-23，去掉中间忙碌的几天，也差不多用了5天的时间认真学完，全是精华动力来自偶然间看到的B...[作者空间]
越来越多的同学开始自己尝试做10X单细胞转录组数据分析了，除了Linux的基本命令之外，首先用到的软件是cellr...[作者空间]
文章来源：scenic: single-cell regulatory network inference and...[作者空间]
刘小泽写于19.8.21+28这次花费的时间较长，个人感觉这个包比Seurat、Scater难学，说明文档写的实在...[作者空间]
刘小泽写于19.8.21 需求来源 我想从文章（例如：DOI: 10.1038/s41467-018-07582-...[作者空间]
