点击关注,桓峰基因 今天就来剖析一下单基因到底怎么做?这个事情也算困扰好多老师的一个难题,总有有老师来问我,我就有...[作者空间]
这期讲讲单样本基因富集分析,这个也蛮有意思的之前我已经介绍过基因集富集分析(GSEA),但是当时是用差异基因来分析...[作者空间]
点击关注,桓峰基因 基于RNA数据做临床预测时,我们往往并不知道该对样本怎么分类,那么就需要对肿瘤样本进行分类或...[作者空间]
GSVA 也是 SCI 文章中常见的分析方法,在我们获得多个pathway的时候,可以比较pathway在样本分组...[作者空间]
关注公众号,桓峰基因 这期继续补充一下转录组高级分析内容之一的筛选Hub基因,这个模块在 SCI 文章中也是经常出...[作者空间]
蛋白互作网络分析同样也是 SCI 文章中出现频率最高的分析方法,下面就给大家梳理一下流程! 前言 蛋白质互作网络(...[作者空间]
依稀记得10年前一个样本的RNA-SEQ费用还是蛮高的,而现在就是洒洒水啦,所以这种转录组的数据也已经成为文章的主...[作者空间]
前言 上期我们聊了一下数据库,可以直接使用,但是有的时候我们还是需要对新数据进行融合基因的检测,一般来说 RNA ...[作者空间]
基于 RNA 数据分析1-13期基本介绍完成,而基因融合同样也是转录组测序中能够获得的对于临床上非常有意义的数据,...[作者空间]
免疫浸润也是近几年肿瘤研究的一个重要方向。通过表达数据即可推算出这个整体样本中究竟有哪些免疫细胞。下面我们就基于数...[作者空间]
前言 目前基于RNA做分析的文章中几乎都有 GSEA 的分析内容,并且都是出现在正文,那么这个也是表达基因筛选的一...[作者空间]
全网最全 GO 注释结果绘图,直击 SCI 绘图标注,关注我,您最好的选择! 前言 1. GO 原理 基因组测序已...[作者空间]
这期我们了解一下 TCGA 数据的癌种,以及简称,如何快速准确的定位到指定的数据! 01数据库选择 我们如果想看...[作者空间]
前言 上期我们介绍了基于 limma 来做差异表达基因,那么这期来讲一下 DESeq2,那么这两款软件有什么区别吗...[作者空间]
在RNA-seq中,主成分分析(PCA)是最常见的多元数据分析类型之一,这期主要介绍一下利用已有的表达差异数据如何...[作者空间]
火山图也是 RNA 数据分析中 SCI 文章中出现频率最高的图形,那么我们该怎么绘制这样一幅高质量可发表的图形呢?...[作者空间]
01. 前言 在不久的将来,预计新兴的数字基因表达(DGE) 技术在许多功能基因组学应用方面将超越微阵列技术。其中...[作者空间]
基于 RNA 数据的分析还有很多展示形成,我这里都会一次介绍,以及最后的 SCI 文章中的组图,完成所有分析流程,...[作者空间]