这期我们了解一下 TCGA 数据的癌种，以及简称，如何快速准确的定位到指定的数据！
01数据库选择
我们如果想看数据信息，可以考虑 UCSC Xena (xenabrowser.net) ，在 hub 上可以看到各种类型的数据库，这里我们选择 TCGA Hub, 如下：
进入页面后，我们发现 TCGA 数据库上对应的癌种的全称以及缩写，如下：
02 TCGA的癌症名称，简写和中文名称
我们看到 TCGA 数据上 38 Cohorts, 715 Datasets，那么我这里给出 35 种癌种对应的中英文名称以及缩写，方便大家检索，以后对着列表找癌种即可，表格如下：
癌种 缩写 中文名称
Adrenocortical Cancer ACC 肾上腺皮质癌
Bladder Cancer BLCA 膀胱尿路上皮癌
Breast Cancer BRCA 乳腺浸润癌
Cervical Cancer CESC 宫颈鳞癌和腺癌
Bile Duct Cancer CHOL 胆管癌
Colon Cancer COAD 结肠癌
Colon and Rectal Cancer COADREAD 结直肠癌
Large B-cell Lymphoma DLBC 弥漫性大B细胞淋巴瘤
Esophageal Cancer ESCA 食管癌
FFPE Pilot Phase II FPPP FFPE 试点二期
Glioblastoma GBM 多形成性胶质细胞瘤
lower grade glioma and glioblastoma GBMLGG 胶质细胞瘤
Head and Neck Cancer HNSC 头颈癌
Kidney Chromophobe KICH 肾嫌色细胞癌
Kidney Clear Cell Carcinoma KIRC 肾透明细胞癌
Kidney Papillary Cell Carcinoma KIRP 肾乳头状细胞癌
Acute Myeloid Leukemia LAML 急性髓系白血病
Lower Grade Glioma LGG 脑低级别胶质瘤
Liver Cancer LIHC 肝癌
Lung Adenocarcinoma LUAD 肺腺癌
Lung Cancer LUNG 肺癌
Lung Squamous Cell Carcinoma LUSC 肺鳞状细胞癌
Mesothelioma MESO 间皮瘤
Ovarian Cancer OV 卵巢癌
Pancreatic Cancer PAAD 胰腺癌
Pan-Cancer PANCAN 泛癌
Pheochromocytoma & Paraganglioma PCPG 嗜铬细胞瘤和副神经节瘤
Prostate Cancer PRAD 前列腺癌
Rectal Cancer READ 直肠癌
Sarcoma SARC 肉瘤
Melanoma SKCM 皮肤黑色素瘤
Stomach Cancer STAD 胃癌
Testicular Cancer TGCT 睾丸癌
Thyroid Cancer THCA 甲状腺癌
Thymoma (THYM) THYM 胸腺瘤
Endometrioid Cancer UCEC 子宫内膜样癌
Uterine Carcinosarcoma UCS 子宫癌肉瘤
Ocular melanomas UVM 眼部黑色素瘤
这样就很清楚了，数据选择也是文章开始的重中之重，您选对数据集了没？
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