矩阵数据提取[作者空间]
本目录为单细胞相关分享索引，持续更新.... 1.上游数据处理 01.单细胞测序上游-数据下载（适用于图形化界面）...[作者空间]
前言 作者开发Scissor的目的是结合bulk-seq的数据，寻找与某一性状显著相关的单细胞亚群，然后从表型的角...[作者空间]
现在回想单细胞项目的一些常规分析，clusters/groups间的差异表达分析（differential exp...[作者空间]
scRNAseq免疫细胞注释： 免疫细胞注释-1：T细胞[https://www.jianshu.com/p/01...[作者空间]
![文献学习005--[sc]如何开始单细胞测序数据分析](https://img.haomeiwen.com/is15771939/37b8c831e8676c4b.png)
这篇综述今年6月1日发表在Journal of the American Society of Nephrolog...[作者空间]
参考：https://satijalab.org/seurat/articles/essential_comman...[作者空间]
单细胞GSEA分析需要的文件有两个：1. 单细胞基因表达变化数据（两列，一列是geneid/gene symbol...[作者空间]
1. 背景 Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)用来评估一个预先定义的基因集的基...[作者空间]
RNA velocity原理此前已经介绍过，参考单细胞测序的轨迹推断[https://www.jianshu.co...[作者空间]
常用的细胞通讯软件：CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5...[作者空间]
轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p...[作者空间]
SCENIC官网：https://rawcdn.githack.com/aertslab/SCENIC/701cc...[作者空间]
要实现单细胞mRNA测序，需要解决2个难题：1. 一个人类细胞中，RNA总量大约只有10pg左右（1pg=10-1...[作者空间]
一、Seurat v3.2 对空间转录组Visium的结果分析中实现的功能： 归一化 降维和聚类 检测空间可变特征...[作者空间]
一文了解单细胞对象数据结构/数据格式，单细胞数据操作不迷茫。本文内容包括 单细胞seurat对象数据结构， 内容构...[作者空间]
上一篇已经讲解了Seurat标准流程，推文的最后，注意到了不同样本之间的表达数据是存在批次效应的，就像下图这样，有...[作者空间]
在之前的文章里，我主要讲了如下两个内容：(1) 认识Cell Hashing；(2): 使用Cell Ranger...[作者空间]
