快一个月没更新文章啦,今天收到好几个粉丝的催更私信,好的吧,实在对不住大家期待的眼神,看样子不能再拖啦,想想写啥好...[作者空间]
以下只是我自己学习LMM所做的笔记,并不保证完全正确。 基于R的线性混合效应模型(linear mixed eff...[作者空间]
导读 PICRUSt (Phylogenetic Investigation of Communities by ...[作者空间]
导读 要点: !duplicate函数去重做索引 table函数去重统计 order函数进行排序 ggplot g...[作者空间]
经典的转录组差异分析通常会使用到三个工具limma/voom, edgeR和DESeq2, 今天我们同样使用一个小...[作者空间]
从这一章开始我们就来介绍下用R处理双层次的模型 R包 首先介绍一下在多层次模型中,可以用R包nlme的nlme()...[作者空间]
PCA这种图,图片上看起来不同的组别之间是有差异的,比如说这个: 可是各组别之间到底有没有显著的差异呢?普通的AN...[作者空间]
导读 前面已经介绍了获取菌属相对丰度表的方法,以及多样性分析中的基本概念和计算方法。接下来将开始介绍一种寻找组间差...[作者空间]
一、β-多样性分析 1.样品间距离计算 样品间的物种丰度分布差异程度可通过统计学中的距离进行量化分析,使用统计算法...[作者空间]
plot是R中的基本画图工具,直接plot(x),x为一个数据集,就能画出图。细节往往制胜的关键,所以就详细来看下...[作者空间]
https://www.genome.jp/kegg/ko.html KEGG Orthology 简称KO, 对...[作者空间]
1. Adonis vegan包置换多因素方差分析(非参数多因素方差分析),可对OTU矩阵及所有环境因子矩阵进行差...[作者空间]