samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集。包含有许多命令。以下是常用命令的介绍：sambamba...[作者空间]
在做等位基因(allele)的研究中，其中一个重要的步骤就是去除比对偏差。众所周知，人是二倍体生物，在染色体同样位...[作者空间]
1. 使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体我...[作者空间]
做完比对后，最直接的一个问题就是想知道：你的reads比对上了哪些区域没比对上哪些区域，有多少reads比对上特定...[作者空间]
三代数据分析，用Minimap2分析出结果，生成了gff文件，想继续用为了想用到MatchAnno去，但是Matc...[作者空间]
Y叔的RNA-seq workflow 强力推荐 数据已经存在服务器，基因组注释文件、基因组文件都已经存在。服务器...[作者空间]
https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/...[作者空间]
刘小泽写于19.6.8之前最开始学习IGV的时候写过两篇推文，当时简单做了了解，但有朋友说意犹未尽，嗯我也这么觉得...[作者空间]
直接来看例子吧。 左对齐标准化Indel，对于多等位基因位点进行拆分（annovar注释必须的）。 根据条件进行筛...[作者空间]
GATK官方提供了一个SNP过滤的标准，howto-apply-hard-filters-to-a-call-se...[作者空间]
参考染色体大小文件chrom.size 将染色体划分为20bp为一个bin的区间 将染色体划分成20bp为一个bi...[作者空间]
Y叔的clusterProfiler的一大优点就是能够利用最新的KEGG数据库，而不是停留在最后一个公开版的KEG...[作者空间]
刘小泽写于19.5.14最近在分析单细胞数据时，发现了有的数据需要将两个genome、两个GTF组合起来分析，但其...[作者空间]
文章题目 Circoletto: visualizing sequence similarity with Cir...[作者空间]
一：为什么要研究三维基因组？（三维基因组的必然性） 1.1 一维的染色体的情况 我们首先来看一个图 它展示了人...[作者空间]
原文地址: SNP Filtering Tutorial 感觉文章写的真棒，于是就翻译了一遍 目标 学习如何使用V...[作者空间]
官方参考 https://deeptools.readthedocs.io/en/develop/content/...[作者空间]
文献题目：RnBeads 2.0: comprehensive analysis of DNA methylati...[作者空间]
