pcoc检测 step1. 处理树文件；将第2步生成的02_Trees文件夹拷贝到当前目录，并修改为.txt结尾 ...[作者空间]
1. 利用rbh的方法鉴定ortholog 2. 利用convgent_1.2.py生成prank,convert...[作者空间]
基于组装好的基因组，例如某一个基因在该基因组中无注释，需检查是否为注释错误，还是该基因本身缺失。 软件：genbl...[作者空间]
老规矩，先奉上学习资料链接： https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us/a...[作者空间]
有一个文件weizhi，里面是三列数据，以”_“分割，第一列是染色体，第二列是开始位置，第三列是终止位置，另一个文...[作者空间]
已有“OrthoFinder/Results_Jul11/Orthogroups ”[作者空间]
防杠叠甲：下述所有内容均为本人理解，欢迎友好的学术讨论。觉得看不进去的，写的不好的请windows用户移步右上角×...[作者空间]
分子钟假说 基因序列中密码子随着时间的推移以几乎恒定的比例相互替换，即具有恒定的演化速率，两个物种之间的遗传距离将...[作者空间]
记录下小编自己可能用到的小脚本 （1）fasta转phylip格式 用法：python fa2phy.py s...[作者空间]
由于xx原因，需要用Alphafold2的conda版本的本地版本。所以花了两三天终于把alphafold2的co...[作者空间]
之前写过 一套比较简便的基因组组装流程[https://www.jianshu.com/p/a736b1b4b18...[作者空间]
由于分析需求需要使用PhastCons分析DNA的保守序列，以及使用SIFT软件分析氨基酸变异的有害性，经过一段时...[作者空间]
因为课题需要，我们在前期组装了一个基因组并进行了注释，但是存在两个问题，一个是没有考虑可变剪切，另一个是注释的基因...[作者空间]
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s1...[作者空间]
前述，IGV-GSAman 的功能已经更新七七八八，基本可以满足绝大多数情况下的基因结构注释矫正工作需要。不过，我...[作者空间]
在这个例子中，主要的目标是评估基因组组装后的信息，包括染色体的总长度、染色体的数目、染色体的平均长度、最长的染色体...[作者空间]
基因组组装之前，有一些问题还是需要注意的， genome size是多少？ 评估得到的genome heteroz...[作者空间]
https://github.com/sib-swiss[https://github.com/sib-swiss][作者空间]
