其实这个植物是拟南芥,所以跟人类研究的数据处理大同小异。 转录组 转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所...[作者空间]
这次跟着课程(Smartseq2 scRNA小鼠发育学习笔记-1-前言及上游介绍)要练习的文章是:Dissecti...[作者空间]
刘小泽写于19.9.13-23,去掉中间忙碌的几天,也差不多用了5天的时间认真学完,全是精华动力来自偶然间看到的B...[作者空间]
前言 青藏高原是世界上海拔最高、面积最大的高原,平均海拔4500米。由于低氧、低温和强紫外线等恶劣的环境条件,生活...[作者空间]
太长不看版本 DESeq 最新版本(v1.25.9)针对大样本分析的速度和之前相比有了质的飞越,果子老师的 121...[作者空间]
果子老师做过一个非常惊人的举动,用DESeq2处理1225例样本的TCGA数据,在没有使用DESeq多线程参数pa...[作者空间]
水稻转录组分析实战 文章标题: Genes, pathways and transcription factors...[作者空间]
最近在学RNA-Seq,从收集资料开始,将好用的链接先拷过来,方便阅读: 1、 初始数据过滤、质控NGS 数据过滤...[作者空间]
Y叔的RNA-seq workflow 强力推荐 数据已经存在服务器,基因组注释文件、基因组文件都已经存在。服务器...[作者空间]
我们第一周目标有三个: 熟悉Linux环境登录服务器Linux基本命令PATH的意义 学习conda管理环境如何在...[作者空间]
这是我听孟浩巍知乎LiveB站鲮鱼不会飞视频(转录组分析进阶课程)里的笔记哦~ 本次知乎Live解决的问题: 转录...[作者空间]
本文目标:(1)使用edger包做TCGA数据库RNA-seq数据差异分析(2)使用deseq包做TCGA数据库R...[作者空间]
Kallisto下游推荐的分析软件是Sleuth,所以我们本次介绍如何使用Sleuth进行相关的分析。 RNA-s...[作者空间]
本文我们来简单介绍一下非常快捷好用的一个RNAseq工具——Kallisto。Kallisto被我推荐的原因是其速...[作者空间]
本分析从HISAT2比对的counts开始,先整合所有的counts数据,再获取再半数以上样本中CPM>1的基因,...[作者空间]
刘小泽写于19.4.20+4.25前段时间事情有点多,但是我又回归啦!!!来到大美横琴,感觉活力满满~舒心工作,开...[作者空间]
有一个朋友问了我一个问题,DESeq2的baseMean是如何计算?我最初都是认为baseMean计算的是对照组的...[作者空间]
前期文章 一个超简单的转录组项目全过程--iMac+RNA-Seq(一)一个超简单的转录组项目全过程--iMac+...[作者空间]
知识的学习没有一蹴而就,没有捷近,扎实的学习是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的综述,全面而详细!深度好文...[作者空间]
现在转录组测个序大概是1000-2000块钱一个样,这个波动的范围取决于各个公司提供的服务,以及你们那个地区生信的...[作者空间]