hello，大家好，今天我们来分享多组学数据推断RNA Velocyto，大家做velocyto的时候估计都是用R...[作者空间]
1. 介绍 CoRegNet包的目的是从转录组数据推断大型转录共调控网络，整合外部数据和基因调控信息去推断和分析转...[作者空间]
简介： immunarch包是一个主要面向于医学科学家和生物信息学家们设计的，专门针对 T 细胞受体 (TCR) ...[作者空间]
hello，大家好，最近呢，10X单细胞核转录组 + 10X单细胞ATAC的多组学测序技术日渐成熟，因为这样技术同...[作者空间]
最近年中总结，我们学习一下基础知识 R版本 桑基图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用riverplot...[作者空间]
关于什么是“拟时序分析”，可以参考本期推送的另一篇推文。这一篇直接演示代码 monocle2这个软件用得太多了，很...[作者空间]
打脸时刻来了~~~~之前在Linux下用SRA Toolkit下载数据效果不好，所以，果断的将它拉入了黑名单。但是...[作者空间]
ID转换过程中会有基因丢失这件事情，在部分做干实验的人看来，是非常正常的。但不做干实验的湿实验人知道这件事，心里可...[作者空间]
Monocle3和Monocle2并没有本质上的区别，只是把降维图从DDRTree改成了UMAP。原因可能是包的作...[作者空间]
对于肿瘤的单细胞样本，在做完细胞质控和细胞类型鉴定之后，可以进入CNV分析。 CNV(Copy number va...[作者空间]
目录：1. 原理介绍2. 操作演示3. 关于Harmony操作是否会对差异分析产生影响 1. 原理介绍 官网：ht...[作者空间]
第八节：拟时序细胞轨迹推断 在本节教程中，我们将学习如何通过拟时序分析推断细胞分化轨迹。slingshot包可以对...[作者空间]
参考：1.Package ‘RCircos’[https://cran.r-project.org/web/pac...[作者空间]
写在前面 全基因组层面可视化特征标记（如基因位点），从文字标签到图形标签。文字标签应该是三四年前实现的。图形标签，...[作者空间]
系列回顾：1.RNA velocity分析练习（一）文件下载以及预处理2.RNA velocity分析练习（二）软...[作者空间]
系列回顾：1.RNA velocity分析练习（一）文件下载以及预处理 要获取我们需要的loom文件，你需要先安装...[作者空间]
目前有多种方法可以进行RNA velocity的分析： scVelo（参考文章：单细胞转录组数据分析|| scVe...[作者空间]
