参考资料:https://docs-python.higlass.io/[https://docs-python....[作者空间]
Raw contact to .hic → juicer_tools 软件地址:https://github.c...[作者空间]
在上一篇笔记里,介绍了如何从fastq文件得到.cool文件(.mcool)(Hi-C分析练习(从fastq文件到...[作者空间]
前期的时候,我们画ABcompartment 往往需要个性化嵌入以下代码: 自从研究了pyGenomeTrack之...[作者空间]
在前面我们介绍了ABcompartment分析的软件 cworld 软件(https://www.jianshu....[作者空间]
【Juicer loop】HiCCUPS HiCCUPS call loop的算法如上。 用法如下:hiccups...[作者空间]
Juicer Tools 简介以及前期处理 Juicer 软件分析流程以及几大模块,如下图所示: JUICER主要...[作者空间]
ABcompartment和TAD主要采用cworld 软件进行分析。 Cworld 软件架构如下: Cworld...[作者空间]
参考之前的文章 hic分析之 hic-pro 介绍与安装 分步工作原理: 先看test文件 再看看opt文件 工...[作者空间]