Wray NR, Kemper KE, Hayes BJ, et al. Complex Trait Predic...[作者空间]
我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程，并提供了基本的命令，用到的软件包括BWA、samtools、gatk、...[作者空间]
Melo, 2019, ‘apparent’: a simple and flexible R package f...[作者空间]
Testing pipelines for genome-wide SNP calling from Genoty...[作者空间]
该流程有：GWAS的QC，PCA分析，Manhattan图，QQ图，候选位点的功能分析 参考学习资料：Genome...[作者空间]
Ratcliffe, B., El-Dien, O.G., Klápště, J., Porth, I., Che...[作者空间]
Hayes, B., Goddard, M., 2010. Genome-wide association and...[作者空间]
ASReml和sommer都可以进行GBLUP育种值预测，区别在于对加性关系矩阵G矩阵的使用及结果。ASReml用...[作者空间]
进行GS前，需要将标记格式转成012格式，0表示低频allele的个数，即M矩阵。在R中有包synbreed和SN...[作者空间]
GS中的GBLUP需要估计分子关系矩阵。所有的估计方法都是参考[@van Randen, 2008]中的公式及几种...[作者空间]
最近在用Colony，和Cervus有所区别。下面是翻译自Colony的用户指南，供理解学习。 1.介绍 Colo...[作者空间]
在GWAS研究中，Manhattan plot和QQ plot是最常画的两类图，它们可以把跟研究的性状（比如，基因...[作者空间]
1、群体结构及其对 GWAS 的影响 群体结构的来源image.png群体结构对GWAS的影响--混淆变量Ance...[作者空间]
在R中读入序列，并得到反向、互补或反向互补序列。[作者空间]
刘小泽写于18.7.18表型与基因型相关联（基因定位）是遗传学上的重要问题。 什么是重测序Resequencing...[作者空间]
欢迎关注"生信修炼手册"！ bwa 是一款将序列比对到参考基因组上的软件，包含了以下3种算法 BWA-backtr...[作者空间]
一次简化基因组数据分析实战 尽管目前已经有大量物种基因组释放出来，但还是存在许多物种是没有参考基因组。使用基于酶切...[作者空间]
最近跑通了一遍GWAS分析，全程在linux操作，虽然具体还有好多需要微调的地方，先把代码整理分享出来mark一下...[作者空间]
El-Dien OG, et al. (2016) Implementation of the Realized ...[作者空间]
