Ratcliffe2015

Ratcliffe, B., El-Dien, O.G., Klápště, J., Porth, I., Chen, C., Jaquish, B., El-Kassaby, Y.A., 2015. A comparison of genomic selection models across time in interior spruce (Picea engelmannii × glauca) using unordered SNP imputation methods. Heredity 115, 547–555. https://doi.org/10.1038/hdy.2015.57

gs与常规基于系谱选择在林木育种单个育种循环的时间需求上有极大的优势，这一点对林木育种人员极具吸引力。分型群体为来自25个自由授粉家系的769个子代。性状是从3-40连年的树高数据，用于检验gs方法的时间动态性。分型方法是gbs。评估了3个gs模型的预测准确性，及标记效应值。预测准确性中等0.31-0.55，随时间变化显著，因为株间竞争。预测准确性与年-年遗传相关系数有极强的正相关；但随着时间差的增加而显著下降。在缺失值推断上，k-最近邻和奇异值分解的效果好于均值法。岭回归和bayescpi效果相当，预测准确性高于广义岭回归异方差效应模型。