笔记主要内容：1~3代测序技术，fastq文件 & FASTQC （1）测序技术 1、一代测序技术：Sanger ...[作者空间]
在上一篇文章中，介绍了利用gffread进行gff和gtf的格式转换，但是会丢失一些信息，比如UTR，因此这篇文章...[作者空间]
前言 我的认知里，fasta格式中“>”只会位于行首。但是我写脚本用的示例数据里出两行特殊id。这两个id中除了行...[作者空间]
根据id提取vcf（提取重测序数据不会有日志等啰嗦行） 根据染色体提取vcf 根据位置提取vcf（pos文件含染色...[作者空间]
随着测序技术的发展，每天都会有不少的测试数据上传到NCBI SRA等的数据库上，但是如果快速稳定的下载上传好的数据...[作者空间]
给root用户设置密码 打开终端，输入命令sudo passwd，输入当前用户的密码，然后系统会提示输入新密码En...[作者空间]
视频地址，此系列视频讲的比较详细。本部分内容包括 TAB键填充和路径目录结构ls和tree文件和目录创建文件和目录...[作者空间]
5.1 wc wc命令计算文件的行数，字数和字节数用法 -c 只显示bytes数-l 只显示行数-w 只显示字数 ...[作者空间]
1 grep用法 2 grep参数 选项描述:-i 忽略大小写。不会区分大小写字符。也可用--ignore-...[作者空间]
刘小泽写于19.5.8很久之前写过关于grep的知识，生信Linux文本处理三剑客 。使用了一段时间后，又有一些更...[作者空间]
1基础命令: cd -, cd .. , history, !5 , /home/ , /tmp/ , >,&，...[作者空间]
生信星球狗粮特供：我们的公众号生信星球的开始，就是我正式开始学生信的时候，零星时间看过的东西都会忘，只有找个办法p...[作者空间]
刘小泽写于19.3.2上一次说到了怎样找到特定的列（比如：$3 == "gene"以及返回特定的列（{print ...[作者空间]
刘小泽写于19.3.1最近一直忙毕业论文，感觉过去的一周像是过去的一个月一样，快接近尾声了，知道我的朋友都知道，我...[作者空间]
好久没有更新了，BBQ开始继续更新啦~今天的BBQ关注的是基因注释这一块，举个例子来说，分析转录组，我们得到了...[作者空间]
最近在探索全基因组基因家族的分析方法，而找到某一家族需要通过保守结构域来预测，从而找到物种的某一基因家族，从而进行...[作者空间]
fasta文件处理小工具 前边我们简单介绍过什么是fasta格式，。看下面的例子就好了 类似上边的格式就是fast...[作者空间]
