首先非常感谢CJ老师开发的TBtools工具,给生信分析带来了极大的便利,详细内容介绍请参考https://www...[作者空间]
说到发文章,相信大家公认的套路都是“找分子-养细胞-养老鼠“的湿实验套路,这样的实验一旦做起来,至少都要耗掉1-2...[作者空间]
Methods and tools for RNA-seq-based co-expression network...[作者空间]
WGCNA的理论背景知识WGCNA的详细分析流程关键模块和hub基因筛选,在流程中并不可知模块划分好后如何找到ke...[作者空间]
WGCNA是一种从大量数据中挖掘module的算法,而这些module所包含的gene为一组表达模式类似或这说表达...[作者空间]
看这个之前,可以先看WGCNA的一些理论背景知识看完整个之后可以去看WGCNA关键模块和hub基因筛选 相似的表达...[作者空间]
MCODE,Molecular COmplex Detection发现PPI网络中紧密联系的regeions,这些...[作者空间]
已有: 知道某原核生物某转录因子的DNA序列 目标基因的基因组测序数据 另外还有这个转录因子的靶基因的ORF序列 ...[作者空间]
新建文件夹进化分析1 包括1多序列比对与可视化Mega(Muscle)进行序列比对,JalView进行多序列比对结...[作者空间]
包括基因成员的序列特征分析(分子量等电点等)基于motif分析成员序列保守特征与可视化(蛋白与核酸,可用于挖掘未知...[作者空间]
写在前面:非常感谢CJ开发出如此强大的TBtools工具,作者详细讲解了基因家族的分析过程和意义,课程购买地址,讲...[作者空间]
多序列比对,进化树分析,motif预测,密码子偏好性分析(1)进行BopA蛋白序列下载,多序列比对及进化树分析后,...[作者空间]
前言:假如类鼻疽杆菌中发现有一个感兴趣的gene,想查看此gene在各类鼻疽菌株甚至原核生物和真核生物中是否也表达...[作者空间]
上一篇GSEA可以做什么之后,继续进行结果解读 1 Enrichment score(ES) ES是GSEA最初的...[作者空间]
基因集富集分析GSEA(gene-set enrichment analysis)。这个操作并不难,主要就是准备符...[作者空间]
系统功能注释和生物网络可视化 Spatial Analysis of Functional Enrichment(...[作者空间]
A: ClueGO:破译富集GO和通路 大多数的富集工具都是以列表和复杂等级树显示。Cluoego可视化归纳相似的...[作者空间]
1.在CTD里,哪些基因被注释到哮喘病相关 广泛的定义为“对于一个给定的基因集来说,哪些基因和某疾病相关?”哮喘病...[作者空间]
基本功能 为了产生不同类型的网络,DisGeNET的控制面板提供了可以调整的参数。包含三个标签:gene dise...[作者空间]
对所有生物过程来说,基因表达的精确调控对基因表达是非常重要的。序列特异性的转录因子结合在DNA 识别区域(cis调...[作者空间]