很多朋友问是如何保持阅读量的，其实，大部分是之前的存货。有一部分是每有会意，把之前的旧书拿出来再翻一翻，做个导图放...[作者空间]
本节概览：1.获取DEG结果的上下调差异基因2.bitr()函数转化基因名为entrez ID3.利用cluste...[作者空间]
转录因子(Transcription factors, TFs)作为转录调控的重要组成部分，鉴定、分类和注释转录因...[作者空间]
今天来给大家分享的是：怎么一行命令完成RNAseq数据差异分析+火山图+散点图。 一、准备3个文件： 1、基因表达...[作者空间]
1、什么情况下用RNAseq RNAseq是一种高通量测序技术。它可以帮助我们理解在各种比较条件下，所有基因的表达...[作者空间]
目的 一个新的物种（没有参考基因组）用Trinity从头组装得到的转录本fasta文件，需要将其转换成gtf文件 ...[作者空间]
Differentially-Expressed Gene Analysis clp 12 June, 2020 ...[作者空间]
写在前面 做基因功能的人都会特别注意基因上有什么功能结构域，通常我们认为，结构域决定了这个基因的功能。随着高通量测...[作者空间]
图来自： 需要注意的是DNA双链，只是部分区段是正义链，部分是反义链。换另一个区段可能完全相反。 以下部分内容是搬...[作者空间]
参考： 孟浩巍的知乎zhn 第10题 读懂FastQC报告之adapter与kmer Hello大家好！ 我们又见...[作者空间]
mRNA-seq上中游分析需要用到Linux系统的terminal！ 尽管TCGA数据库中已经提供了大量的处理好的...[作者空间]
参考文献：Transcript-level expression analysis of RNA-seq expe...[作者空间]
目标 BSgeome自己有很多构建好的基因组，但是对于非模物种来说，有时候我们需要自己构建基因组的信息。如何根据物...[作者空间]
下载参考基因组所需的三个文件：1.基因组序列(genome.fa); 2.基因注释文件(genes.gtf)；3....[作者空间]
序列的多比对情况大家都懂，因为NGS时代，序列都很短，也就是50-250bp范围，而且参考基因组本来就是会有很多低...[作者空间]
Edirect是非常有用的工具其使用要用来perl，mac都预先安装了perl安装的时候最好按下面进行打开终端 显...[作者空间]
trimmomatic是一款用来处理illumina测序数据的工具，可以是单条的single reads，也可以是...[作者空间]
