直接给我惊呆了,从点开开始到出结果一共32秒ಥ_ಥ,想当年光blastp就得跑大半天,更不要说编译MCScanX,...[作者空间]
写在前面 伴随着越来越多的全基因组序列公布,比较基因组分析已然常规生信数据分析技能。MCScan 是最为常用的软件...[作者空间]
定义 直系同源基因 - Orthologous genes (or orthologs) are a partic...[作者空间]
软件介绍 首先放官网:MCScanX-transposed: detecting transposed gene ...[作者空间]
写在前面 TBtools 命令行接口一直保留着我开始开发 TBtools 的时间。至今已有五年,也迭代了 至少15...[作者空间]
Mar 20,2020 更新! 什么是InterProScan数据库 InterPro provides func...[作者空间]
刘小泽写于19.8.5AnnotationDbi应该是进行富集分析时最常用的注释包了,所以有必要好好了解一下 简介...[作者空间]
方法一:基于hmm模型的鉴定方法 1.准备数据①下载拟南芥基因组fasta文件、注释文件gtf/gff3文件:ft...[作者空间]
基因家族流程:基因家族分析(一) 基因家族流程:基因家族分析(二) 基因家族流程:基因家族分析(三) ======...[作者空间]
遇到的问题:fungene上的氮循环基因narG.hmm数据太老 http://fungene.cme.msu.e...[作者空间]
确定的研究基因家族 在做基因家族的研究直接,首先你要确定你需要研究的对象(基因家族是什么?) 一般来说选择基因家族...[作者空间]
Data preparation 继续上次的内容,下载好数据后就可以正式开始鉴定了。首先回顾一下,下载好的数据。 ...[作者空间]
前言 最近在看一些关于生态、遗传、基因组进化等的文献,其中有个很多人用的也用了很久的用以判断物种选择压力的数值,(...[作者空间]
包括基因成员的序列特征分析(分子量等电点等)基于motif分析成员序列保守特征与可视化(蛋白与核酸,可用于挖掘未知...[作者空间]
写在前面:非常感谢CJ开发出如此强大的TBtools工具,作者详细讲解了基因家族的分析过程和意义,课程购买地址,讲...[作者空间]
基因家族是最近比较火的一个研究话题,被称为打开生物学问题百宝箱的钥匙,接下里几周抽时间和大家简单分享一些我最近学到...[作者空间]
什么是Ka/Ks The ratio of the number of nonsynonymous substit...[作者空间]
HMMER软件在基因家族成员挖掘分析过程中具有重要作用。 本文将从HMMER软件的下载与安装、并结合一个实际例子对...[作者空间]
更新20181216 今天又把KaKs_calculator2.0的帮助手册翻出来看了一遍,找到了一句话:Befo...[作者空间]
简单介绍 HMMER,从软件名字来看就知道其实用的隐式马可夫模型来做分析的,具体是用于分析生物序列。虽然他也可以当...[作者空间]