原文链接:https://my.oschina.net/u/4503882/blog/4511789[https:...[作者空间]
差异分析完以后,就有了基因列表和差异倍数,有了这两个东西,就可以用clusterprofiler做GSEA,然后有...[作者空间]
做生物学研究的人,难免会遇到各种各样的基因ID号。有我们比较熟悉的也比较直观的基因名字,如TP53。也有其他数据库...[作者空间]
1.数据标准化 (1)标准化 (2)样本总体分布 (3)样本之间的相关性 2.差异表达分析 (1)limma包分析...[作者空间]
一、数据整理 1 导入数据 利用data.table包导入数据,以LUAD为例 2 选择感兴趣的临床信息 一般常规...[作者空间]
准备工作 需要你先安装好R-3.6.0 、Rtools-3.5、Rstudio,这是基本的运行环境。 然后再此基础...[作者空间]
DESeq2进行数据标准化的命令有多种 counts(dds, normalized=T) rlog、VST 两者...[作者空间]
今天跟大家分享的是2019年12月份发表在Aging (Albany NY).(IF: 5.515)杂志的一篇文章...[作者空间]
寻找TCGA数据库中既含有TNBC组织又含有正常组织的病人,把数据下载下来,跑流程。总共有十个病人。代码过程如下。...[作者空间]