ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements) 作为DNA调控元件百科全书整合了1w+...[作者空间]
对于ATAC文库而言,其插入片段的长度分布有着非常典型的规律,示意如下 每200bp会存在一个峰,这个周期性波动反...[作者空间]
0_1 前言 有时间再详细写introduction。先把我分析数据的流程记录下来,后续持续更新。 0_2 用到的...[作者空间]
2021年开年第一篇笔记~ 这篇笔记主要记录DiffBind包的学习。在很久以前我写过一篇ATAC-seq分析流程...[作者空间]
参考: 给你bam文件,你会画插入片段长度分布图吗? 糗世界-ATAC-seq 「文献02」esATAC: 一个A...[作者空间]
ChIP(Chromatin immunoprecitation)是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。 “...[作者空间]
在实践之前,我先查找了一下有关组蛋白修饰的知识点:(参考文章:https://www.jianshu.com/p/...[作者空间]
质控 Tools for QC plotCorrelation 此工具基于multiBamSummary或mu...[作者空间]
学习目标: 学会用MACS2 call peaks 理解MACS2 call peaks的结果 Peak Call...[作者空间]
参考生信技能树1以及生信技能树2只记录从数据下载,到最终结果展示,具体生物学知识请自行查阅稍后关于ChIP-seq...[作者空间]
安装默认使用Conda macs2的基本命令 输出文件包括 为了方便在IGV上查看ChIP-seq的结果和后期的可...[作者空间]