eggnog注释 使用在线版 eggnog-mapper 进行 eggnog 数据库注释。 eggnong数据库全...[作者空间]
由于原核生物编码基因不包含内含子,由连续的编码区构成开放阅读框(ORF),编码区具有容易辨别的序列特征,基因预测准...[作者空间]
宏基因组组装 基因组组装,即把短的reads拼装成连续的序列(contig),再根据PE或者long reads等...[作者空间]
DESeq2/edgeR DESeq2和edgeR是RNA-Seq数据分析中常用的差异表达分析软件,这两款软件基于...[作者空间]
差异物种分析主要基于物种丰度信息和样品分组,进行组间差异物种的检测。这里使用 lefse 进行差异物种分析。 LE...[作者空间]
β多样性 β多样性:指沿环境梯度不同生境群落之间物种组成的相异性,也被称为生境间的多样性(between-habi...[作者空间]
基于测序数据,使用 kraken2 进行 reads 的物种注释,使用 braken进行丰度估计,之后基于丰度进行...[作者空间]
微生物 微生物泛指个体无法用肉眼观察的微小生物,一般需要借助光学显微镜或电子显微镜才能观察到。 研究策略 单菌研究...[作者空间]
马作为研究后肠发酵食草动物消化的模型系统,其马肠道的微生物组成如何?马肠道微生物组和马性能之间存在什么关系?为回答...[作者空间]