转录组分析 上一节,我们简单介绍了 CNV 数据的处理以及突变数据可视化。下面我们简单介绍一下转录组数据分析中必不...[作者空间]
TPM是RNAseq测序结果里很好的归一化表达矩阵,以前都是FPKM,但目前TPM才是主流,很多测序公司也开始用T...[作者空间]
葡萄的参考基因组下载自NCBI,下载链接是https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes...[作者空间]
写这篇文章一部分原因是填2年前的一个坑 转录组入门(7):差异表达分析. 另一部分原因是GQ最近又在搞一波无重复...[作者空间]
测序深度(Sequencing Depth) 相当于测了几遍; 指测序得到的总碱基数(bp)与所测物种基因组大小的...[作者空间]
引用本文:邓飞龙, 贾先波, 赖松家, 等. 转录本组装与质量评价. 生物工程学报, 2015, 31(9): 1...[作者空间]
WGCNA的原理如果不掌握的话,就很难在做WGCNA分析的过程中,利用手中的代码去修改参数,就无法得到满意的图图。...[作者空间]
Trinity是Broad Institute和Hebrew University of Jerusalem开发的...[作者空间]
刘小泽写于18.10.10很早就见过它,但只是不明觉厉,直到昨天才开始认真了解是这样的:昨天上午看了一篇文献,讲冠...[作者空间]
因为样本数量比较可观,所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析,挑选的标准可以是...[作者空间]