背景介绍 伪时间是衡量单个细胞在细胞分化等过程中取得了多大进展的指标。在许多生物学过程中,细胞并不是完全同步的。在...[作者空间]
关于什么是“拟时序分析”,可以参考本期推送的另一篇推文。这一篇直接演示代码 monocle2这个软件用得太多了,很...[作者空间]
Monocle3和Monocle2并没有本质上的区别,只是把降维图从DDRTree改成了UMAP。原因可能是包的作...[作者空间]
轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p...[作者空间]
参考: 第六章 scRNA-seq数据分析 使用monocle包进行pseudotime分析 monocle2 官...[作者空间]
Monocle可以进行下面三种类型的分析,可以与seurat无缝连接: 1 对细胞进行聚类、分组和计算;2.进行拟...[作者空间]