基因与基因组 基因 基因是DNA分子中含有特定遗传信息的一段核苷酸序列,是遗传物质的最小功能单位 基因的分类(按照...[作者空间]
本节概览:1.STRING数据库基本介绍2.STRING R语言版——STRINGdb的使用:STRINGdb数据...[作者空间]
写在前面:经常做转录组分析,就是把差异基因搞个火山图和Venn图看各组差异基因的共有和特有情况。看见有个比较好的选...[作者空间]
在对动植物杂交种(或F1子代)的基因组和转录组的关联研究中,要回答这么一个问题:基因组变异到底与基因表达有什么关系...[作者空间]
RNA缩略词详解 lncRNA:长链非编码RNA(long non-coding RNA) miRNA:微小RNA...[作者空间]
最近学习画单细胞的拟时序轨迹图,有一些收获。大家经常使用的一般是monocle,DPT等;RNA velocity...[作者空间]
准备文件及软件 ViennaRNA-2.4.17(重要) ncbi-blast-2.9.0+ bowtie miR...[作者空间]
最近在看植物长链非编码RNA的论文,其中一个分析步骤是鉴定lncRNA中可能是属于miRNA前体的序列 基本步骤是...[作者空间]
Introduction 除了利用ballgown流程,目前比较流行的方法还是通过序列比对和计数获得的计数矩阵,然...[作者空间]
stringtie官网[http://ccb.jhu.edu/software/stringtie/index.s...[作者空间]
下载psRoBot http://omicslab.genetics.ac.cn/psRobot/download...[作者空间]
来自(https://github.com/Dukunbioinfo/pipeline-for-lncRNAs/b...[作者空间]
RNA 数据下载后,如果处理成read counts matrix的话,是一定要进行基于基因长度的标准化的(TMP...[作者空间]
作者:椰子糖审稿:童蒙编辑:amethyst 可变剪切能够产生多种类型的mRNA,因此一个基因就可以产生多种不同的...[作者空间]
GATK4流程学习之背景知识与前期准备 - 简书[https://www.jianshu.com/p/97e803...[作者空间]
今天给大家分享一篇与lncRNA–miRNA–mRNA调控网络预测相关、发表在Journal of Cancer ...[作者空间]
作者:Arno审稿:童蒙编辑:angelica 引言 Iso-seq测序经初步分析获得高质量的转录本之后(全长转录...[作者空间]
前面我们介绍过miRNA 靶向预测软件targetscan[https://link.zhihu.com/?tar...[作者空间]
一.流程介绍 后续会开发lncRNA、smallRNA、circRNA流程首先是lncRNA流程,主要分析模块为:...[作者空间]
献给初学者:Q-PCR 计算看这一篇就够了 原文转自:献给初学者:Q-PCR 计算看这一篇就够了上次看了「一文教你...[作者空间]