一、 写在前面 2023年4月中旬自己开始做基因家族的分析，对于这块自己没有接触过，因此也是一个挑战，没事！！！（...[作者空间]
这里是佳奥！新的一年，ATAC-Seq的学习也进入了尾声。 让我们开始吧！ 1 peaks注释 统计peak在pr...[作者空间]
基本思路就是利用phylosuite软件下载序列，串联寻找mrbayes和iqtree软件的模型，然后用多线程的m...[作者空间]
泛基因组（Pangenome）：指的是某一物种全部基因的集合 （A Pangenome refers to a c...[作者空间]
结构变异 结构变异是指在物种中遗传和多态性的基因组DNA中的大规模结构差异。它们是染色体重排的结果 （缺失，复制，...[作者空间]
Github: https://github.com/biobakery/MetaPhlAn/wiki/MetaP...[作者空间]
一、 MANorm介绍 MAnorm是一个稳健的模型，用于定量比较 TF（转录因子）或表观遗传修饰的 ChIP-S...[作者空间]
可视化dotPlotly[https://github.com/tpoorten/dotPlotly]工具，是利用...[作者空间]
上一篇推文主要介绍了一下Multi-omics Hammer软件的Aligment功能，本篇就接着上一篇推文继续介...[作者空间]
对于科研人员而言，很好的展现数据是工作中的必要技能，图最为可视化的最主要形式是最为简单直接的一种表现方式。但...[作者空间]
全基因组DNA甲基化实验怎么做？从技术原理、建库测序流程、信息分析流程和研究套路等四方面详细介绍。 一、全基因组甲...[作者空间]
基因家族的概念 基因家族 : 来源于同一个祖先，由一个基因通过基因复制而产生的两个或多个拷贝而构成的一组基因，他们...[作者空间]
MUMmer 4 是一个快速比对 DNA 或蛋白序列的软件，最常用的 program 就是 nucmer 和 pr...[作者空间]
pacbio三代全长转录组数据分析isoseq31 参考官方文档及其他教程，包括原理、流程等 2 软件安装主要参考...[作者空间]
基于重测序数据用于对sv进行genotype. githup: https://github.com/Illumi...[作者空间]
WGDI这个最新的共线性算法软件到现在还没有正式发表，只能在网上搜到BioRxiv版，根据笔者的初步了解，似乎是一...[作者空间]
一、使用Regtag将contig挂到染色体上 二、使用Repeatmasker进行基因组数据屏蔽： 三、基因预测...[作者空间]
Tag SNP 理论上，研究者通过对全部一千万个SNP位点都进行基因分型，也能够寻找到这样的区域。但是，目前用这种...[作者空间]
记录今天学会的一个小知识：统计测序文件的reads长度分布 由于某些原因，需要统计reads长度分布对建库方法进行...[作者空间]
前言 原理简单介绍 工具介绍2.1 参数介绍2.2 代码模板 其他说明 前言 当我们拿到多个ChIP-seq数据时...[作者空间]
