看这个之前,可以先看WGCNA的一些理论背景知识看完整个之后可以去看WGCNA关键模块和hub基因筛选 相似的表达...[作者空间]
刚参加完生信技能树TCGA挖掘培训回来,里面内容有不少涉及GEO数据分析方面。下面整理一些非常值得一读都一些文章,...[作者空间]
帮同学处理一下他从公司拿到的差异分析结果,当然,给我的是Excel表格,老规矩,导出csv然后读入R,然后准备顺手...[作者空间]
声明:本文用到的clusterProfiler, DOSE, enrichplot均是Y叔的作品,本人只是辛勤的搬...[作者空间]
承接上一篇的数据,画一个韦恩图,出来的是在三个GEO数据集中均上调或均下调的基因的交集图。代码如下: 首先我们用上...[作者空间]
基因功能的富集分析已成为高通量组学数据分析的常规手段,对于揭示生物医学分子机制具有重要意义。关于GO、KEGG、G...[作者空间]
在进行目的芯片的差异分析之前,有两大拦路虎,一只是混杂因素;另一只,就是今天的问题,目的芯片的Agilent平台的...[作者空间]
前言 我们统一选择p<0.05而且abs(logFC)大于1的基因为显著差异表达基因集,对这个基因集用R包做KEG...[作者空间]
这是我在 The Bioinformatics Knowledgeblog 上看到的一篇教程,原文在这里,教程条理...[作者空间]