刚参加完生信技能树TCGA挖掘培训回来，里面内容有不少涉及GEO数据分析方面。下面整理一些非常值得一读都一些文章，帮助初学者掌握一些基本概念，基本流程。一旦你理解并学会使用R了，那么进行自定义地分析就不难了。
Bioconductor分析基因芯片数据
如何使用GEOquery和limma完成芯片数据的差异表达分析
基因芯片（Affymetrix）分析1：芯片质量分析
基因芯片（Affymetrix）分析2：芯片数据预处理
基因芯片（Affymetrix）分析3：获取差异表达基因
基因芯片（Affymetrix）分析4：GO和KEGG分析
基因芯片（Affymetrix）分析5：聚类分析
使用oligo软件包处理芯片数据
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芯片数据中常用图 GEO芯片上游处理流程
我们在做数据分析的时候，经常需要产生一些重复序列。例如，GEO芯片数据差异表达分析[https://link.zh...
现在写表达谱芯片分析教程，就像是落后了几个时代一样。但是 GEO 等数据库包含了大量的芯片表达数据，工作时也难免需...
GEO数据库挖掘：多芯片联合分析教程
基因芯片数据挖掘分析表达差异基因 基因芯片数据分析（一）：芯片数据初探 基因芯片数据分析（二）：读取芯片数据 基因...
看过很多GEO数据挖掘的教程，一直都是芯片数据举例。我自己也根据流程（Taolu）分析过好几个geo芯片数据。一直...
本文讲的是aglient芯片原始数据的处理，参考资料是limma 的userguide文档。GEO数据库下载的表达...
前面简单给大家介绍过 GEO数据库数据检索方法（一）[http://mp.weixin.qq.com/s?__bi...
前些天我在介绍GEO数据挖掘技术应用到RNA-seq数据分析的推文：GEO数据挖掘技术可以应用到表达芯片也可以是转...
本文标题：【r<-芯片处理】入门GEO表达芯片数据分析该读一读的一些
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