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1、富集分析的背景知识 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/...[作者空间]
What：什么是GO和KEGG？ GO全称是Gene Ontology，它分为：细胞组分（cellular com...[作者空间]
检测基因组选择信号的方法有很多种，其中 XP-CLR 方法是常用的一种。XP-CLR 是陈华老师、Nick Pat...[作者空间]
写于20201114这部分，我是进行了基因组各个组分的一些统计。详细内容如下： 01.DMR和NSR在基因组中各个...[作者空间]
当我们进行群体分析时，获得vcf文件后，可以根据变异位点对这些样本进行PCA分析，现简单介绍 1、软件安装 2、简...[作者空间]
EWAS（Epigenome-Wide Association Study，表观基因组关联分析）其实就是用表观数据...[作者空间]
在组学分析中，我们常常会看到曼哈顿图，密度分布图，bin图等，之前我以为ggplot2画density plot的...[作者空间]
使用DMR进行PCA的主要目的是为了探究亚群中DMR是否存在大的差异，可以将不同亚群分开。因为我们知道DMR在植物...[作者空间]
亲缘关系分析实操 前期准备 给标记加上ID SNP data通常都是以VCF格式文件呈现，拿到VCF文件的第一件事...[作者空间]
WGBS 实验 BS 处理 C->U(T) 转化效率不是 100% 的，转化失败的部分 C 会成为假阳性信号，所以...[作者空间]
在《WGBS 全基因组甲基化测序》)讲解了 WGBS 测序原理，简而言之是 BS 处理将未甲基化 C 转化为 U(...[作者空间]
DNA甲基化是一种被广泛研究的表观遗传修饰方式，与组蛋白修饰等方式一起，在调控基因表达和染色质构象等方面发挥了重要...[作者空间]
1.聚类 聚类属于无监督式学习。在无监督式学习中，训练样本的标记信息是未知的，算法通过对无标记样本的学习来揭示蕴含...[作者空间]
和甲基化有关的。可以先了解下甲基化：450k甲基化基础450K甲基化芯片数据处理传送门450k甲基化芯片常用工具包...[作者空间]
从根本上说，MethylC-Seq技术实际上就是Bisulfite Sequencing (BS-Seq)方法的优...[作者空间]
表型分析之最优无偏预测 最佳线性无偏预测（Best Linear Unbiased Prediction，简称BL...[作者空间]
vcftools是一种可以对VCF文件和BCF文件进行格式转换及过滤的工具，其中很多过滤及计算功能我们可以自己使用...[作者空间]
