昨天的教程我很喜欢,以后再配上个基因启动子转录调控因子筛选的技能,就是神技中的神技。跟Nature一起学习TCGA...[作者空间]
编者按:本文介绍了新版Seurat在数据可视化方面的新功能。主要是进一步加强与ggplot2语法的兼容性,支持交互...[作者空间]
刘小泽写于19.9.20来自:https://bioconductor.org/packages/3.9/work...[作者空间]
刘小泽写于19.8.19主要介绍官方教程PBMC 3K的下游分析(https://satijalab.org/se...[作者空间]
刘小泽写于19.8.9-第三单元第五讲:利用scRNAseq包学习scater笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录...[作者空间]
看过我TCGA肿瘤数据库知识图谱的小伙伴都只是如何在任意癌症查询指定感兴趣基因的表达量,并且对样本进行分组比较,网...[作者空间]
基于R的统计习题30个 统计学是一门很深的学问,这里仅仅是出题帮助大家熟练使用R语言来学习统计学知识,具体知识点需...[作者空间]
刘小泽写于19.7.18+28官方总共有7个数据集,涵盖了新版本的不同亮点这一次跟着教程https://satij...[作者空间]
对生信分析中得到的一些基因,进行KEGG富集分析,达到对基因进行注释和分类的目的。 本文利用R语言的ggplot2...[作者空间]
关于拟时分析的一些基本知识请参看以下两篇及其参考文章: scRNA-seq拟时分析 || Monocle2 踩坑教...[作者空间]
刘小泽写于19.7.9-第二单元第九讲:生物学背景知识之细胞周期推断笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探索...[作者空间]
刘小泽写于19.7.5笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术课程链接...[作者空间]
limma分析差异基因 在经过了前两期中的数据下载,数据基本处理之后,解决了一个探针对应多个基因数的以及多个探针对...[作者空间]
最近学习了生信菜鸟团的纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度,想复制作者的流程,但是发现了几个不一样的地...[作者空间]
STREAM STREAM (Single-cell Trajectories Reconstruction,...[作者空间]
刘小泽写于19.6.24、29和花花毕业流浪,武汉完事转向成都继续进行剩下两个数据集 第二个数据--CEL-seq...[作者空间]
需求 最近做个性化分析,突然发现一张能够很好反应差异富集的柱状图,如下图所示; 测试数据生成 生成的测试数...[作者空间]
只要一行动,时间过得很快,第二周也过去了。上一周我们也做了不少事情,主要还是展示了一下,如何在数据调整能力过关的情...[作者空间]
刘小泽写于19.6.23-24文章来源:https://bioconductor.riken.jp/package...[作者空间]
刘小泽写于19.6.18、23笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术...[作者空间]