基因流（也称基因迁移）是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因...[作者空间]
前几天，实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的...[作者空间]
如果根据SNP或者Indel 构建其系统进化树，可以展示群体中不同个体的相互关系，基因变异相似的往往会在同一个树的...[作者空间]
系统发育学概念 系统发生（或种系发生、系统发育，phylogeny）是指生物形成或进化的历史。系统发生学(phyl...[作者空间]
这是一个非常老的软件，距离他不更新至少有10多年了，但是目前还是有很多公司用他进行基因组注释，包括ENSEMBL的...[作者空间]
很早之前就觉得用DNAMAN做的多重比对导出来的图不是很好看了，而且后期还要进行PS或者PPT进行修饰。 因此，到...[作者空间]
欢迎关注天下博客：http://blog.genesino.com/2018/03/linux-search/Ju...[作者空间]
00 写在前面 一般公司会提供clean data和后续的基础分析结果。因为可能需要自己来进行数据的预处理，记得拿...[作者空间]
前言 因为组里面出了一批甲基化测序数据，使用的技术为BS-seq，处理的时候顺带记录了学习过程，演示使用数据为官方...[作者空间]
昨天看到一个同学操作linux系统，系统报错信息显示一个文件的第一千多行有问题。她的操作方式是把服务器里的这个文件...[作者空间]
先说明 本推文出发点就是……个人觉得有趣 本推文已尽可能地保证零基础的朋友能在windows下完全重现，但不保证每...[作者空间]
前言 : 随着NGS(Next Generation Sequencing)技术日益成熟，如今一台设备一天可产生1...[作者空间]
CD-hit 参数解读 -i 设置输入文件 -o 设置输出文件，可以将每次分析的ID阈值放到名称中，方便以后使用，...[作者空间]
全局比对 Global Alignment 由芝加哥的Needleman和Wunsch两位于上个世纪70年代初提出...[作者空间]
前前后后做了一些转录组拼接的工作，而且目前还在持续进行中。期间遇到了各种各样莫名其妙的坑，也尝试了一些不同的方法和...[作者空间]
关于如何call variant的问题之前已经陆续整理过一些文章，但是每次分析需要call variant的数据都...[作者空间]
最近在python for biologists看到一篇对正则表达式不错的总结，在此简要翻译。 模式在生物学中的重...[作者空间]
如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候，大家得到的序列都是单个基因的长度，所以一般都是逐个基...[作者空间]
由于基因组太大，我们不得不分散测序，然后将分散的顺序按照原来位置进行组装，而基因组存在大量重复顺序，会干扰排序，因...[作者空间]
