JiekaiLab/scDIOR: scDIOR: Single cell data IO softwaRe[ht...[作者空间]
前言 说到单细胞数据分析,不得不提的一个工具就是基于R语言构建的一站式分析软件--Seurat。即使目前每年都有很...[作者空间]
前言 如今单细胞转录组分析已经广泛应用于人类肿瘤疾病的相关研究中,然而在这些研究中仍有一项具有挑战性的工作,就是区...[作者空间]
之前大多数 single cell 技术都是静态的刻画 cell state(即都是snapshot),没有能够引...[作者空间]
作者,Evil Genius 世事无常 315打假日 2月26日获知家里电信诈骗,到今日过去了17天,从一开始的...[作者空间]
随着单细胞测序技术的发展,各种多组学技术都被逐渐引入到这一大家庭中来。上一期我们给大家介绍了单细胞转录组+表面蛋白...[作者空间]
文章接受,终于有空再发点笔记了? SCENIC_Tutorial[#scenic_tutorial]Setup[#...[作者空间]
关键词 随机取样细胞 Downsample cells 分组随机选取细胞 适用背景 之前的博客提到,R语言处理大数...[作者空间]
写在前面 感谢califano-lab[https://github.com/califano-lab]团队将代码...[作者空间]
更多内容请访问个人公众号---KS科研分享与服务--- 接上节(跟着Cell学单细胞转录组分析(二):单细胞转录组...[作者空间]
一、ScaleData()简介 单细胞基因表达counts矩阵数据经过NormalizeData()归一化处理后,...[作者空间]
在看文献Single-cell RNA sequencing of blood antigen-presentin...[作者空间]
如果你已经尝试了100种错误方法,恭喜你,找到家了。这个是99.9%能保证成功的安装方式。如果你第一篇就看到这个,...[作者空间]
不知道大家在研究单细胞数据整合函数FindIntegrationAnchors[https://satijalab...[作者空间]
Unbiased integration of single cell multi-omics data 单细胞测...[作者空间]
我们首先再认识一下PCA 数据做PCA分析的前提是1、主成分分析认为主元之间彼此正交,样本呈高斯分布;2、主成分分...[作者空间]
在做整合分析的时候发现这个参数被改来改去,竟然还不知道是什么意思。 问题:设置DefaultAssay 为"int...[作者空间]
###################################### 题目:单细胞数据的导入与质控 - S...[作者空间]
image.png Classifying your cells Load your data 构建好细胞分类器之...[作者空间]
inferCNV用与探索肿瘤单细胞RNA-seq数据,分析其中的体细胞大规模染色体拷贝数变化(copy numbe...[作者空间]