1. Introduction GDC(Genomic Data Commons, 基因组数据共享中心)接收、处理...[作者空间]
在NGS分析入门阶段，我们不需要考虑太多的细节，只用知道一个分析的大致流程并完整跑下来即可。太多的细节，只会让我们...[作者空间]
刘小泽写于19.5.3 软件环境 原始数据一般是以SRR格式存放，这个文件一般都要几个G，于是下载器首选ascp，...[作者空间]
人类基因组计划启动20年，目前出了很多基因组版本2013年的GRCh38/hg38 （最新）2009年的GRCh...[作者空间]
过滤软件的比较与选择：cutadapt/fastp/trimmomatic 注：还没有完全搞明白，先总结一下特点和...[作者空间]
生物信息学基础——基因表达过程 2016年11月15日 19:10:55 vickyleexy 阅读数：799遗传...[作者空间]
首先，基因本体论（Gene Ontology）和基因文库不是同一概念。 我从下面几个方面讲一下GO的一些概 念和基...[作者空间]
bowtie2： 单端： bowtie2 -p 20 [options] -x index -U sample.f...[作者空间]
介绍 开源包管理系统和环境管理系统 ，包括多种语言的包安装，运行，更新，删除，最重要的是可以解决包依赖问题 支持语...[作者空间]
![[R]R包ChAMP学习资源整合](https://img.haomeiwen.com/us1203538/5b080ee5-c746-4e63-8abf-939ede876b88.png)
我们先把ChAMP安上，嘿嘿，其他一切都好说 详细的帮助文档可以通过以下命令行查看 帮助文档的简单译文如下：[R]...[作者空间]
刘小泽写于18.10.15内容很多，资料就准备消化了一上午，写了一下午+一晚上～开心搞定基因的身份实在太多，因为每...[作者空间]
在跟着健明老师学习生物信息学的过程中，少走了很多弯路，躲过了很多坑，在指导下浅尝过一些。但是自己常常扣原理，又...[作者空间]
NCBI-SRA和EBI-ENA数据库 SRA数据库: Sequence Read Archive：隶属NCBI ...[作者空间]
最近在复习HGVS命名，当做个人翻译笔记吧。 HGVS，全称是Human Genome Variation Soc...[作者空间]
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这一次的资料给出了详细的计算公式，并且有R做模拟验证的code。 在我实际处理NGS data时候，从测序数据中自...[作者空间]
在做NGS data处理的时候，常常会遇到需要使用picard和samtools 进行remove PCR dup...[作者空间]
阅读完本文后，请看这一篇慎用Anaconda进行软件管理 conda的确是一个非常好的工具，对于初学者而言，安装软...[作者空间]
