[R]R包ChAMP学习资源整合

今天，一个小师妹问我用过ChAMP这个包没？本着不重复早轮子的原则，我又不要脸的开启了一波ChAMP学习资源的整理。

我们先把ChAMP安上，嘿嘿，其他一切都好说

# R>3.50安装ChAMP  bioconductor近来启用新的R包安装方式，替代以往source("...") bicLite("...")
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("ChAMP", version = "3.8")

# R<3.50安装ChAMP
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("ChAMP")

详细的帮助文档可以通过以下命令行查看

browseVignettes("ChAMP")

帮助文档的简单译文如下：
[R]ChAMP帮助文档译[上]-甲基化分析流程(The Chip Analysis Methylation Pipeline)
[R]ChAMP帮助文档译[下]-甲基化分析流程(The Chip Analysis Methylation Pipeline)

万能的网络啥都有，来来来，来一波ChAMP学习资源的目录：

• 1.ChAMP 包分析甲基化数据
• 2.(转帖）Shiny和Plotly实现可交互DNA甲基化分析包ChAMP
• 3.微信公众文
• 4.850K甲基化芯片数据的分析