Hi-C fastq data to valid pair and matrix data format tran...[作者空间]
拖拖拉拉用了一年时间才把GWAS整个流程捋完,从背景到code、还有过程中遇到的一些bug以及解决办法,加起来也有...[作者空间]
做生信的朋友一般对软件都不陌生,我们处理数据的整个过程或多或少的都会用到各种发表的软件,今天来和大家聊聊如何进行软...[作者空间]
1.教学网站或博客类[https://babyding.github.io/2021/08/31/%E7%94%9...[作者空间]
第一次接触到三代测序数据,拿到手里的只有bam文件 查了一下有工具可以直接将bam文件转换为fastq https...[作者空间]
在此介绍一个可直接筛选的脚本select_longest_transcripts.pl 重点改写第25, 28, ...[作者空间]
这次分享一下简单的生信数据挖掘发文思路,文章发表在Biomed Research International上,该...[作者空间]
LAI是一种新的评估基因组组装质量的评价标准。转载自https://www.jianshu.com/p/f962d...[作者空间]
这是一篇由中国广东潮汕地区浪险猴同学写的笔记。本人学习很多东西整理的笔记个人认为比较直观,用词刺眼,如有冒犯,多多...[作者空间]
这个计划搁置了好久,凑巧最近实验室有人要毕业,找参考文献格式没找到。那还是写吧,早晚都得写。 先看看我华农的参考文...[作者空间]
PCA分析与解释 PCA是一种无参数的数据降维方法,常用的机器学习算法一种,这篇文章主要从PCA应用于解释两个方面...[作者空间]
杂合度 heterozygosity 某个位点的第个等位基因的样本频率为,那么该位点所有等位基因的频率和应该是1。...[作者空间]
写在前面:新手老菜鸟,个人心得,不足之处欢迎交流指正;写作不易,转载前请联系我征得同意,谢谢。 1.基本原理 1....[作者空间]
方案1: 不纠错直接组装。输入数据分为两种情况,一种是用所有的原始数据(包括长度过滤2K/5K以下),一种则是选择...[作者空间]
接着上一篇留下的问题,如何按照以1M为窗口,每次移动10Kb计算均值。我们以KY131是"0/0", 而 "DN...[作者空间]
刘小泽写于19.9.13-23,去掉中间忙碌的几天,也差不多用了5天的时间认真学完,全是精华动力来自偶然间看到的B...[作者空间]
上一篇写的是:重复一篇文献的GWAS(一):基因型数据整理这一篇主要讲GWAS的核心流程和画图。 软件使用参考:使...[作者空间]
有些时候,换个配色就能让你的图片上一档次。我准备在这篇文章中整理出一些好看的配色方案。 virids 调色盘 安装...[作者空间]
1.先来认识一下circos的配色体系 下载安装circos之后,在安装目录下面有一个png图片,上面显示的是ci...[作者空间]
上个月中旬,出于对GWAS的好奇,我参加了一个培训班,之后又花了一周的时间来整理听课笔记,感觉现在对GWAS已经有...[作者空间]