hisat2 构建索引 hisat2 比对 hisat2 比对软件将 reads 比对到参考基因组[https:/...[作者空间]
使用工具 fastp(质控), hisat2(比对), samtools(sam文件转bam文件), featur...[作者空间]
差异表达分析内容:• 基因表达量的标准化方法及可视化➢ counts,RPKM,FPKM,TPM➢ PCA图、热图...[作者空间]
Q:该如何选择limma, DESeq2, edgeR A:各有各自应用的场景 如果是芯片数据,一般选择limma...[作者空间]
了解如何利用 Linux 文件安全系统和共享数据 更多精彩 更多技术博客,请移步 IT人才终生实训与职业进阶平台 ...[作者空间]
5软件安装在上一篇资料搜集的链接中大神们已经详细介绍 以下是我参照链接自己跑的流程命令 比对 hisat2 $ h...[作者空间]
一句话评价通过动态模型评估细胞瞬间状态的RNA速度 文章信息题目:Generalizing RNA velocit...[作者空间]
数据读入 使用airway中的数据,SummarizedExperiment格式。 如果没有SummarizedE...[作者空间]
本文参考文献https://www.nature.com/articles/nprot.2016.095#mate...[作者空间]
fastq1和fastq2特定的cluster的序列 @SRR8980088.3 fastq的identifier...[作者空间]
批次校正的原因和方法 校正批次效应这篇说可以用combat来进行批次校正校正批次效应这篇说limma和combat...[作者空间]
【作业1】请根据R包org.Hs.eg.db找到下面ensembl 基因ID 对应的基因名(symbol) [提示...[作者空间]
如果我有一段区间,想要知道这段区间对应的参考基因组到底是什么样的序列,需要自己去写程序来把这段序列抓出来吗?不!因...[作者空间]
前言——主要内容 这篇笔记是StatQuest系列视频教程的第39-43节,其中39节的内容是PCA;第40节的内...[作者空间]
ComplexHeatmap学习笔记①Introduction to ComplexHeatmap package...[作者空间]
第一部分 背景介绍 为了方便起见,直接选用airway的数据作为训练数据 基因注释 第二部分 得到DGEList,...[作者空间]