随着基因组数据的不断完善，序列信息的不断更新，一个物种的基因组会有多个不同的组装版本。以人为例，目前就有hg16、...[作者空间]
一、简介 limma应用于RNA-seq数据时，read counts被转换为log2-counts-per-mi...[作者空间]
由于之前在推文更新版｜Zotero搭配Sci-Hub，真香！中使用的Sci-Hub的.se近期挂掉了，因此有必要对...[作者空间]
按：RNA-seq 流程非常多样化，每一个步骤可选工具都非常多。我的选择是 StringTie 进行组装取得 re...[作者空间]
为了确定从样本(sample)统计结果推论至总体时所犯错的概率，我们会利用统计学家所开发的一些统计方法，进行统计检...[作者空间]
一、安装软件 1、HISAT2 将reads比对到基因组上 2、StringTie 将比对好的reads进行拼装并...[作者空间]
此节内容均为书籍 《数据挖掘与 R 语言》第二章的 数据缺失部分 书籍英文名为 《Data Mining with...[作者空间]
DEseq2筛选差异表达基因并注释(bioMart) DESeq2对于输入数据的要求1.DEseq2要求输入数据是...[作者空间]
批次校正的原因和方法 校正批次效应这篇说可以用combat来进行批次校正校正批次效应这篇说limma和combat...[作者空间]
想要批量完成工作，又不想学习编程怎么办，其中一个好办法就是花钱找人帮忙，谈钱伤感情，那还是学习一些技能吧，下面介绍...[作者空间]
一个基因在不同的数据库有不同的名字：1.Entrez gene ID：我们一般说的Gnen ID即Entrez g...[作者空间]
如何下载公共数据并将不同版本的基因组坐标进行互相转换？ 这就需要介绍另一个包了叫AnnotationHub同样，先...[作者空间]
NCBI中会将测序等数据压缩成sra格式。本文介绍如何批量下载sra文件及转化为Fastq格式。 下载SRA文件s...[作者空间]
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要，去除一些无用的序列...[作者空间]
