The MEME Suite http://meme-suite.org/index.htmlJASPAR - a...[作者空间]
一、什么是进化树 系统发育进化树 (Phylogenetic tree):** 一般也叫系统进化树,进化树。它可以...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! ChIPseeker是使用的最广泛的peak注释软件之一,提供了以下多种功能 peak...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! ChIPpeakAnno是一个bioconductor上的R包,针对peak call...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! annoPeakR是一个peak注释工具,基于R语言中的shiny包开发出的web应用...[作者空间]
为了分析不同类型、组织起源肿瘤的共性、差异以及新课题。TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行...[作者空间]
这是我听B站鲮鱼不会飞视频(GO,KEGG,DO富集分析)里的笔记哦~当然有的地方加上的是我自己的理解,如果哪里和...[作者空间]
deepTools 是一套基于python开发的工具,适用于有效处理分析高通量测序数据,可用于ChIP-seq, ...[作者空间]
需要解决的问题: 准确获取基因X的某个保守区域H的蛋白序列及核酸序列,查看该段序列蛋白层面及核酸层面的变化情况。 ...[作者空间]
刘小泽写于19.3.15好了,终于可以学新知识了【预计将是一项大工程】,单细胞测序是目前研究的热点,那么我重新回来...[作者空间]
前面我们从GDC下载了TCGA肿瘤数据库的数据,也能够把GDC下载的多个TCGA文件批量读入R 今天我们讲一下TC...[作者空间]
3D Genome 可视化工具 可视化工具介绍 4D nucleome (http://www.4dnucleom...[作者空间]
最近在进行ATAC和RNA-Seq的联合分析,由于处理的材料是时间相关的,所以time-course也是一个可以分...[作者空间]
前言:微博参与话题 #给你四年时间你也学不会生信# 先前的富集分析教程[1]主要是以模式物种人为例子,展开的分析,...[作者空间]
给学徒的ATAC-seq数据实战 本次给学徒讲解的文章是 :The landscape of accessible...[作者空间]
刘小泽写于18.8.19之前写过三次关于转录组的实战小文,但是说实话,的确当时还不理解其中的含义,只是想跑个流程,...[作者空间]
学习目标 学习用DiffBind流程评估两个样本间的差异结合区域 用PCA评估样本间的关系 评估不同工具得到的差异...[作者空间]
上一篇介绍了使用ChIPseeker对peaks的分布和邻近基因的注释。除此之外,下游分析通常还包括鉴定我们感兴趣...[作者空间]
上一步骤(第6篇:重复样本的处理——IDR)用IDR对重复样本peaks的一致性进行了评估,同时得到了merge后...[作者空间]
第四周 2018— 06.11-06.17原文: chromVAR: Inferring transcriptio...[作者空间]