motif 分析

The MEME Suite http://meme-suite.org/index.html
JASPAR - a database of transcription factor binding profiles http://jaspar.genereg.net/
植物转录因子Motif分析 https://ke.qq.com/course/1348424
MEME:motif分析的综合性工具 https://www.jianshu.com/p/6bb6967c455d
meme本地版的使用 https://hui-liu.github.io/blog/meme%E6%9C%AC%E5%9C%B0%E7%89%88%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8/
MEME(Motif-based sequence analysis tools)使用说明 https://www.plob.org/article/7115.html
[转载]点鼠标就能找启动子区的motif | meme-FIMO http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=3372875&do=blog&id=1096326
Motif预测 https://wenku.baidu.com/view/65b967cbbdeb19e8b8f67c1cfad6195f312be8ec.html

The MEME Suite数据库下载

1. 网页版的meme太慢了，下载了本地版在linux上跑，在用centrimo的时候需要和数据库里的motif比对，所以数据库也需要下载。

2. 在JASPAR中下载meme格式，发现是一个压缩包里几千个分开的motif文件，找半天没看到整个plant的pfm文件，终于在meme网站左边看见Databases下面还有个Download & Install，于是直接下载Motif Databases。

   
   3)7J)9B2KJ27_0M$B8DZ7L9.png