文章流程 下载VarScan方法的TCGA的maf突变格式文件 计算突变基因,寻找至少在15个样本都存在突变的基因...[作者空间]
####下载GRCm38 snp和indel vcf文件 #### ftp://ftp-mouse.sanger....[作者空间]
SNP通常联合基因表达进行分析 SNP主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可...[作者空间]
3.1 DNASeq 数据分析SNP/Indel 策略 策略一: BWA + Samtools /Picard +...[作者空间]
本人通过无数个网上文章的指导,无数个萝卜的坑,终于摸索出了一整套完整的、傻瓜式的寻找全基因组的SNP实操流程。 仅...[作者空间]
欢迎关注"生信修炼手册"! bcftools也可以进行SNP calling。在之前的版本中,通常都是和samto...[作者空间]
前言 很多关注我这个专题的朋友都在后台留言,说想了解更多关于SNP过滤的东西。是的,确实这是一个比较重要的问题。第...[作者空间]
网址:https://www.ebi.ac.uk/sites/ebi.ac.uk/files/content.eb...[作者空间]
最近一直在帮师姐根据SNP找基因组上的酶切多态位点,然后给她提供该位点附近1kb的序列,让她去设计引物。由于我本科...[作者空间]
大概是长期的不锻炼使得今天的爬山运动过量了,接着悲剧就是无法入眠。也幸亏明天是周日,干脆就起床码字了。总结下自己前...[作者空间]
理解SNPs之间的联系或连锁不平衡(LD)模式对于单体型的选择具有重要作用,然而,对于密集的SNP图谱,随着区域内...[作者空间]
首先是方法的选择。基于距离的方法有UPGMA、ME(Minimum Evolution,最小进化法)和NJ(Nei...[作者空间]
Pemberton J . 2008. Wild pedigrees: the way forward. Proc...[作者空间]
Recently, I’m studying Genetics and there is an important...[作者空间]