转自 https://yangguang8112.github.io/2017/03/09/%E6%B5%8B%E...[作者空间]
转自 http://www.biodiscover.com/news/research/732481.html 文...[作者空间]
转自http://www.zxzyl.com/archives/789 测序中加入Phix的作用 测序建库的时候,...[作者空间]
成为一个合格的生信工程师必经之路 6大基础知识的掌握 首先你需要了解一些测序基础知识,生物学基础知识,这个主要靠自...[作者空间]
这篇文章源自上周知识星球星友的一个提问。 当时星友感兴趣的地方在于Insertsize可以有什么用,后来知道他(她...[作者空间]
首先安装软件 先安装conda,使用清华的conda,说明书:https://mirrors.tuna.tsing...[作者空间]
这源自于我2013年的一篇旧文,另外,那篇文章也已被转载得有些走样了,我决定要重新组织。虽然主体没有大的变化,但是...[作者空间]
今天,继续把发在“解螺旋技术交流圈”的部分主题整理出来,分享给你。 1. 请问对于同一份BAM文件使用samtoo...[作者空间]
在上一篇文章中,分享了有关基因组Phasing的原理,一共有三种,分别是:家系关系分型(Related indiv...[作者空间]
1. RNA-Seq是否可以替代WES完成对外显子的变异检测?这不但省去用探针做外显子捕获这个步骤,代价更小;而且...[作者空间]
这是我根据之前的WGS系列和GATK4实践文章进行重新梳理之后确定下来的分析流程,这是一个WGS的最佳实践,它基于...[作者空间]
什么是Phasing? Phasing,或者说Genotype Phasing,它的中文名有很多:基因定相、基因分...[作者空间]
00 写在前面 仅针对人类WGS或WES数据,供参考。时间管理某一点:能自动化的工作尽量自动化,不要时间用在毫无意...[作者空间]
前言 在上一篇文章中我已经用例子仔细跟大家分享了WGS从原始数据到变异数据(Fastq->VCF)的具体执行过程。...[作者空间]
实质上,两种做法都可以。但是在NGS数据分析中,约定俗成的做法是:左移(left alignment)!然而也有一...[作者空间]
二代测序文库读长的影响因素-实验角度简介 一、现市场上,常见的文库长度种类1)life的Ion Torrent平台...[作者空间]
经过了第四节的长文,我想大家基本上已经知道了一个WGS流程该如何构建起来了吧。但在那一节中限于篇幅有两个很重要的文...[作者空间]
这篇文章很长,超过1万字,是本系列中最重要的一篇,因为我并非只是在简单地告诉大家几条硬邦邦的操作命令。对于新手而言...[作者空间]
从这一节开始详细讲述正式流程的搭建,我将结合具体的例子努力争取将这个系列写成比GATK最佳实践更加具体、更具有实践...[作者空间]
NCBI对应UCSC,对应ENSEMBL数据库:GRCh36 (hg18): ENSEMBL release_52...[作者空间]