一、组蛋白结构 我们都知道在细胞核中的染色体是高度压缩的,而折叠时DNA缠绕的就是组蛋白。将组蛋白区域放大,我们就...[作者空间]
这里是佳奥!初步注释了peaks,并在组件进行了比较,下一步便是用.bw文件计算相关性了。 1 ChIP-Seq分...[作者空间]
本节讲解如何进行 motif 预测,seqlogo 和motif位置展示。 motif预测 motif 预测使用 ...[作者空间]
最近一周开始学习ATAC数据分析,目前只是尝试了简单分析,新手小白,如果有小失误欢迎留言~ 1.准备环境 创建co...[作者空间]
三个讲的很好的参考教程链接 学习一遍ChIPseeker的使用 https://www.jianshu.com/p...[作者空间]
MEME 是一款用于研究 Motif 的 组合工具套。Motif 是指在一组序列中重复出现的相似的序列模式(pat...[作者空间]
1.核酸,基因,DNA,染色体,基因组,同源染色体,等位基因 核酸,基因,DNA,染色体 核酸:一种通常位于细胞核...[作者空间]
MEME 安装 我的一些基本环境 CentOS 7.8 Bash 4.2.46 gcc 9.1.0 并行依赖 / ...[作者空间]
往期精选 使用Signac包进行单细胞ATAC-seq数据分析(一):Analyzing PBMC scATAC-...[作者空间]
一、不求甚解系列 软件下载及配置 conda安装: conda install -c bioconda homer...[作者空间]
开篇致谢:下面内容的整个框架是跟着生信技能树发布在bilibili上的ChIP-seq视频学习的,链接:https...[作者空间]
数据量计算:重测序数据 .fq 格式,wc -l 计算出 行数/4 * 150 =数据量。 参考: 另外,miRN...[作者空间]
上一步骤(第6篇:重复样本的处理——IDR)用IDR对重复样本peaks的一致性进行了评估,同时得到了merge后...[作者空间]
学习目标: 学会用MACS2 call peaks 理解MACS2 call peaks的结果 Peak Call...[作者空间]
前言 ATAC-seq/ChIP-Seq中重复样本的处理ATAC-Seq要求必须有2次或更多次生物学重复(十分珍贵...[作者空间]