基于marker基因的表达情况完成了各cluster细胞鉴定，代码小白后续如何基于细胞注释结果进行绘图呢？别着急，...[作者空间]

所有的学习都是从模仿开始的，所以我又开始跟着小洁老师继续学习了。知识是日积月累的，希望自己走的每一步都是扎实的。 ...[作者空间]

首先感谢生信技能树大神jmzeng1314提供的github包，由于我这边访问github比较困难，因此我已经导入...[作者空间]

TARGET ( Therapeutically Applicable Research To GenerateE...[作者空间]

简介：风险因子关联图常见于cox风险比例模型，常见于下图这种三图联合的展示形式，展示的是由cox风险模型区分出的高...[作者空间]

DCA曲线简介 DCA是一种评估临床预测模型、诊断试验和分子标记物的简单方法。传统的诊断试验指标如：敏感性，特异性...[作者空间]

通常情况下，通过以下几种指标来对模型进行评价。1）区分度：采用指标C-index和ROC曲线来评价区分度，一般文章...[作者空间]

导读 个人笔记，初次分析芯片数据，纯属练习，不涉及生物学意义。 一、数据获取 1 GEO官网中输入GSE编号，检索...[作者空间]

01—研究背景 多因素cox回归分析方法是英国统计学家 D.R.Cox 于 1972 年提出的比例风险回归模型 (...[作者空间]

作为GEO数据的姊妹TCGA数据库中的数据也是生信分析常用的数据之一。 TCGA(The Cancer Genom...[作者空间]

参考文章：【果子学生信】GEO挖掘教程[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIy...[作者空间]

参考：ICGC数据库数据提取表达矩阵/如何提取癌症数据--生信自学网使用spread 出现的坑--刘小泽简书 目的...[作者空间]

下载TCGA数据时，可以采用多种方式进行下载，有使用R 相关的packags进行下载，最新的数据最好是从TCGA官...[作者空间]

一.对于芯片数据： GEO中的Series Matrix File(s)通常是经过了标准化和对数转换的数据，但是不...[作者空间]

一个上午搞定了，难搞的表达矩阵中提取随机样本。 数据包简介： 首先，GSE63885共有100多例病人样本，而我选...[作者空间]

之前的文章里已经按照教程进行了TCGA数据库的一些练习（RNA-seq、芯片、生存分析），现在学习TCGA甲基化数...[作者空间]

TCGA学习01：数据下载与整理 - 简书 TCGA学习02：差异分析 - 简书 TCGA学习03：生存分析 ...[作者空间]

笔记回顾：1.GEO数据库视频学习笔记（芯片数据下载和数据读取）2.GEO数据库视频学习笔记（ID转换）3.GEO...[作者空间]

TCGA学习01：数据下载与整理 - 简书 TCGA学习02：差异分析 - 简书 TCGA学习03：生存分析 ...[作者空间]

之前写的的CHIP-seq和RNA-seq很多练习的数据都是从GEO数据库下载的。但是从来没有细致的了解过GEO这...[作者空间]