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绘制热图与预后评分关系的简易工具

绘制热图与预后评分关系的简易工具

作者: 生信学霸 | 来源:发表于2020-06-23 09:21 被阅读0次

01—研究背景

多因素cox回归分析方法是英国统计学家 D.R.Cox 于 1972 年提出的比例风险回归模型 (proportional hazards regression model), 简称 Cox 回归 (Cox regression)[1-2]。该模型以生存结局和生存时间为应变量,可同时分析众多因素对生存期的影响,能分析带有截尾生存时间的资料,且不要求估计资料的生存分布类型。

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02—使用方法

1.输入数据格式

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表达矩阵:行名为基因名称(至少两个基因),列名为样本名称,如下图所示:

生存信息:共有三列,第一列为样本名称,要与表达矩阵的样本名数据一样;第二列为生存时间;第三列为生存状态,“0”代表存活,“1”代表死亡;程序会自动匹配表达矩阵和样本信息样本名称

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特别注意:

如果是以文件的格式将数据导入到云平台,平台默认无法读取Excel中的数据,必须将Excel文件转为以制表位符分割的文本文件,否则小工具将无法运行。

2.设置参数

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3.结果目录

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4.结果文件

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参考文献

[1] Cox, David R (1972). "Regression Models and Life-Tables". Journal of the Royal Statistical Society, Series B. 34 (2): 187–220.

[2] George B, Seals S, Aban I. Survival analysis and regression models. J Nucl Cardiol. 2014;21(4):686‐694.

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