之前我们发过GSVA分析（有了这个包，猪的GSEA和GSVA分析也不在话下（第一集）[http://mp.weix...[作者空间]
最广为人知的富集分析做法是把上调、下调基因分别或者合并，拿来做GO和KEGG富集分析。经常有一些数据集，拿差异基因...[作者空间]
又是周五，又一周即将过去，人生总会失去很多东西，但是，想到自己的初心，会明白很多的事情。好了，这一篇我们来简单回顾...[作者空间]
对样本进行分级后，通路的分析不适合传统的kegg和gsea分析，下面把单细胞的gsva分析带入tcga分析，原理一...[作者空间]
GENIE3是一种从基因表达数据推断基因调控网络的方法。它训练预测数据集中每个基因表达的随机森林模型，并将转录因子...[作者空间]
首先感谢Y叔的clusterprofiler神包，做富集分析优点是在线爬取数据，结果很可信，但是缺点也是网络问题，...[作者空间]
最近打算开始写一个多组学（包括宏基因组/16S/转录组/蛋白组/代谢组）关联分析的R包，避免重复造轮子，在开始之前...[作者空间]
一般我们做GSEA都是先进行差异基因分析，然后取差异倍数排序结果进行GSEA。但如果你没有条件进行差异基因分析也可...[作者空间]
