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FANTOM5项目

FANTOM5项目

作者: 可能性之兽 | 来源:发表于2022-12-08 22:00 被阅读0次

FANTOM项目是由RIKEN于2000年发起的,旨在建立全方位的人类基因组基因表达数据库。20个国家和地区的超过250名细胞生物学和生物信息学专家,114个研究所参加到了这个项目中。该项目中所用到的主要技术为RIKEN所发展出的Cap Analysis of Gene Expression(CAGE)技术,该技术的优势在于对于基因表达水平的测定具有更高的敏感性。

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FANTOM5项目利用 CAGE 研究了1000多个人类和小鼠原代细胞、细胞系和组织中的转录起始活性。基于对样本信息的人工管理和样本分类本体的开发,得到的数据组合成一个集中的数据资源( http://fantom.gsc.riken.jp/5/)。该资源包含基于网络的工具和数据访问点,供研究团体搜索和提取与 FANTOM5图谱中的样本、基因、启动子活性、转录因子和增强子相关的数据。

数据库的基本使用方式
FANTOM5:人类增强子数据库

Gateways to the FANTOM5 promoter level mammalian expression atlas | Genome Biology | Full Text (biomedcentral.com)

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