美文网首页
2023-04-26如何利用snapgene设计载体引物(酵母单

2023-04-26如何利用snapgene设计载体引物(酵母单

作者: 麦冬花儿 | 来源:发表于2023-04-25 17:10 被阅读0次

最近克隆启动子遇到了困难,经过多方打听,找到了一个合适的方法,进行记录。

目的:克隆2000bp的启动子序列。

第一步:

获得cds上游3000bp(记住,要大于2000bp)序列,可以理解为1000bp+promoter2000bp+cds,该大序列简称‘全长序列’

第二步:

对该序列进行引物设计,注意前引物位于1000bp,后引物位于cds区域
具体操作可以在snapgene中进行
1、将全长序列导入


图片.png

点击下栏的sequence选项


图片.png
分别选中三部分,点击features,并对三部分序列进行标记和命名
图片.png
图片.png
图片.png
图片.png
图片.png

2、分别在1000和cds区域设计引物


图片.png
图片.png
然后就会显示引物的位置
图片.png
图片.png
可以模拟一下pcr
图片.png
选择引物
图片.png
点击PCR
图片.png
结果如下
图片.png
就可以使用该引物对启动子进行粗提取
图片.png

以上是第一次pcr

第三步

接下来进行启动子引物精细提取,和载体组装
1、 加载载体序列pLacZi-2µ和启动子序列


图片.png
图片.png

2 、开始组装(在载体页面进行)


图片.png
选择酶切位点,可以是双酶切,也可以是单酶切,我选的是单酶切
图片.png
图片.png
图片.png

组装完成


图片.png
使用该引物,以以上粗提取的产物为模板进行pcr
图片.png

相关文章

网友评论

      本文标题:2023-04-26如何利用snapgene设计载体引物(酵母单

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/aahmjdtx.html