数据结构
思维导图.jpg
向量
1.元素、向量和标量的区别
首先明确“元素”的意思，元素指的是数字或者字符串（用chr表示）等，根据它可以区分两个词：
标量：一个元素组成的变量
向量：多个元素组成的变量
来源于生信星球
2.理解元素、向量和标量
赋值是他们之间的区别 ，即赋予这个变量一个数值，也可以是 字符串或者数据框等等
x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
x
ps：如果你把这几行代码都打过了，那么x就被你赋值了4次，结果就是，第一次赋值被第二次的覆盖了，第二次的赋值又被第三次的覆盖了，以此类推，以最后一次为准。给变量赋值以后，在右上角那个框看变量，打view()可以在左上角看数据
3.从向量中提取元素
-根据元素位置
#这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
-根据值
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素
数据框
1.读取本地数据
首先一定要把文件放在你运行的文件夹里
生信星球
-sep用来指定字符的分隔符号
csv 文件是用逗号分隔的，故而 sep = ","
tsv 文件是用制表符分隔的，故而 sep = "\t"
常用的分隔符还有空格 sep = " "
header表示将数据的第一行作为标题
奇怪的是 = 、file、sep、header后面都加空格 但是header =T这个=后面没加？？？？？
2.设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
3.数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）
4.变量的保存和重新加载
保存的格式是RData
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
5.提取元素
最后一个更好用，其他的没试出来，总是提示错误。
- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）
6.直接使用数据框中的变量
-将数据框名添加到搜索环境中：attach（a）,作图时就只需输入列名(连$都不用了)，做完后将a删除出搜索环境 detach，但两个以上数据框的列名有冲突时，同时attach会报错。
attach(a)
plot(case,values)
-with
with(a,{
plot(case,values)
x<<-summary(values) #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，也就是出了大括号仍有效。
})
x #运行完后打印x
问题：save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？
答：因为X是大写，换成小写就可以了。
今天的内容刚开始看不懂内容，被动地跟着课程敲代码，但是再次梳理发现有所规律，但是还是不太明白，并不能完全地消化为自己的知识，只能大篇幅引用课程内容。
引自生信星球
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