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nextflow-简单训练-欢迎语

nextflow-简单训练-欢迎语

作者: 单链结合蛋白 | 来源:发表于2023-04-14 21:19 被阅读0次

    欢迎

    欢迎来到 Nextflow 培训工作坊

    我们很高兴能够与您一起探索使用 Nextflow 编写可重复和可扩展的科学工作流程的道路。本指南是 Nextflow 完整文档的补充 - 如果您有任何疑问,请转到此处的文档

    在本课程结束时,您应该:

    1. 能够熟练编写 Nextflow 工作流程
    2. 了解基本的 Nextflow 概念,如通道、进程和操作符
    3. 了解容器化工作流程
    4. 理解 Nextflow 支持的不同执行平台
    5. 认识 Nextflow 社区和生态系统

    概述

    为了让您尽快开始使用 Nextflow,我们将按照以下步骤进行:

    1. 设置开发环境以运行 Nextflow
    2. 使用一些基本的工作流程(包括多步骤的 RNA-Seq 分析)探索 Nextflow 概念
    3. 构建和使用 Docker 容器来封装所有工作流程依赖项
    4. 深入了解核心 Nextflow 语法(sytax),包括通道(Channels)、进程(Processes)和操作符(Operators)
    5. 涵盖集群和云部署方案,并探索 Nextflow Tower 的功能
    6. 这将让您全面了解 Nextflow,以开始编写自己的工作流程。我们希望您喜欢这门课程!这是一个不断发展的文档 - 欢迎反馈意见。

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