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Docker GPU 环境搭建

Docker GPU 环境搭建

作者: Anoyi | 来源:发表于2018-11-30 11:57 被阅读0次

    基础环境信息

    CPU:Intel Xeon E5-2699 v4
    显卡:Nvidia Tesla P100
    操作系统:CentOS 7.4

    基础环境验证

    验证系统是否能正常识别 GPU

    lspci | grep -i nvidia
    

    正常应该显示 Nvidia 显卡的型号,没有任何显示需要更新pci硬件库 update-pciids

    安装 Nvidia 显卡驱动

    1、安装或更新相关包

    yum -y update
    
    # 非桌面版系统可跳过第二步
    yum -y groupinstall "GNOME Desktop"
    
    yum -y install kernel-devel epel-release dkms gcc gcc-g++
    

    重启机器,以确保使用最新的内核!

    2、禁用 nouveau

    nouveau 是一个第三方开源的 Nvidia 驱动,一般 Linux 安装的时候默认会安装这个驱动,它会与 Nvidia 官方的驱动冲突,在安装 Nvidia 驱动之前应先禁用 nouveau

    查看系统是否正在使用 nouveau

    lsmod | grep nouveau
    

    编辑 /etc/default/grub ,在 GRUB_CMDLINE_LINUX 值后面添加

    rd.driver.blacklist=nouveau nouveau.modeset=0
    

    生成新的 grub 配置

    grub2-mkconfig -o /boot/grub2/grub.cfg
    

    编辑或创建 /etc/modprobe.d/blacklist.conf 文件,添加如下内容:

    blacklist nouveau
    

    备份当前镜像并建立新镜像

    mv /boot/initramfs-$(uname -r).img /boot/initramfs-$(uname -r)-nouveau.img
    
    dracut /boot/initramfs-$(uname -r).img $(uname -r)
    

    重启机器后,再次验证系统是否使用 nouveau

    lsmod | grep nouveau
    

    如果还是不行,可以尝试执行 sudo dracut --force 后重启机器

    3、安装 Nvidia 驱动

    Nvidia 官方驱动下载地址:https://www.nvidia.com/object/unix.html

    顶级 GTX 或 Tesla 系列显卡,选择 Latest Short Lived Branch Version,其他选择 Latest Long Lived Branch Version

    当前显卡 Nvidia Tesla P100,选择 Latest Short Lived Branch Version: 415.18

    下载驱动

    wget http://us.download.nvidia.com/XFree86/Linux-x86_64/415.18/NVIDIA-Linux-x86_64-415.18.run
    

    修改 NVIDIA-Linux-x86_64-415.18.run 权限,使其可运行

    chmod a+x NVIDIA-Linux-x86_64-415.18.run
    

    安装 Nvidia 驱动

    # 进入 Linux 文本模式
    init 3
    
    # 安装驱动
    sh NVIDIA-Linux-x86_64-415.18.run --no-opengl-files
    

    DKMS 选择 NO, Nvidia Library 选择 NO

    校验 Nvidia 驱动,执行 nvidia-smi,若有如下输出,证明安装成功:

    卸载驱动

    sh NVIDIA-Linux-x86_64-415.18.run --uninstall
    

    安装 Docker

    参考官方,CentOS 安装 Docker:https://docs.docker.com/install/linux/docker-ce/centos/

    1、移除旧版 Docker

     yum remove docker \
                      docker-client \
                      docker-client-latest \
                      docker-common \
                      docker-latest \
                      docker-latest-logrotate \
                      docker-logrotate \
                      docker-selinux \
                      docker-engine-selinux \
                      docker-engine
    

    2、安装相关包

    yum install -y yum-utils \
      device-mapper-persistent-data \
      lvm2
    

    3、添加 repo 源

    yum-config-manager \
        --add-repo \
        https://download.docker.com/linux/centos/docker-ce.repo
    

    4、安装 docker

    yum install docker-ce
    

    5、启动 Docker

    service docker start
    

    6、设置开机启动

    systemctl enable docker
    

    安装 Nvidia-Docker2

    参考官方,CentOS 安装 Nvidia-docker2:https://github.com/NVIDIA/nvidia-docker

    移除 nvidia-docker 1.0(可选)

    docker volume ls -q -f driver=nvidia-docker | xargs -r -I{} -n1 docker ps -q -a -f volume={} | xargs -r docker rm -f
    
    sudo yum remove nvidia-docker
    

    添加安装包仓库

    distribution=$(. /etc/os-release;echo $ID$VERSION_ID)
    
    curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-docker/$distribution/nvidia-docker.repo | \
      sudo tee /etc/yum.repos.d/nvidia-docker.repo
    

    安装 nvidia-docker2 并刷新 Docker daemon 配置

    sudo yum install -y nvidia-docker2
    
    sudo pkill -SIGHUP dockerd
    

    使用官方 CUDA 镜像测试 nvidia-smi

    docker run --runtime=nvidia --rm nvidia/cuda:9.0-base nvidia-smi
    

    TensorFlow 容器化 GPU 测试

    1、编写测试代码 test.py

    import sys
    import numpy as np
    import tensorflow as tf
    from datetime import datetime
    
    device_name = sys.argv[1]
    shape = (int(sys.argv[2]), int(sys.argv[2]))
    if device_name == "gpu":
        device_name = "/gpu:0"
    else:
        device_name = "/cpu:0"
    
    with tf.device(device_name):
        random_matrix = tf.random_uniform(shape=shape, minval=0, maxval=1)
        dot_operation = tf.matmul(random_matrix, tf.transpose(random_matrix))
        sum_operation = tf.reduce_sum(dot_operation)
    
    startTime = datetime.now()
    with tf.Session(config=tf.ConfigProto(log_device_placement=True)) as session:
        result = session.run(sum_operation)
        print(result)
    
    print("\n" * 5)
    print("Shape:", shape, "Device:", device_name)
    print("Time taken:", str(datetime.now() - startTime))
    

    2、获取 tensorflow 镜像

    docker pull  registry.docker-cn.com/tensorflow/tensorflow:latest-gpu
    

    3、CPU 测试

    docker run --runtime=nvidia \
      --rm -it \
      -v "$(pwd)/test.py:/app/test.py" \
      registry.docker-cn.com/tensorflow/tensorflow:latest-gpu \
      python /app/test.py cpu 20000
    
    CPU 测试结果

    4、GPU 测试

    docker run --runtime=nvidia \
      --rm -it  \
      -v "$(pwd)/test.py:/app/test.py" \
      registry.docker-cn.com/tensorflow/tensorflow:latest-gpu \
      python /app/test.py gpu 20000
    
    GPU 测试结果

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