使用wget下载GEO数据

我们有时需要下载GEO数据，使用getGEO的话比较麻烦，特别是当我们只需要其中某一两个文件时。但是当我们直接复制文件链接，使用wget下载时，却只能下载当前的网页。

经过我的摸索，终于找到了可以使用wget下载GEO数据的方法。

首先在GEO数据库中找到你需要下载的数据

image-20201118163453951.png

右键复制链接地址

image-20201118163600891.png

打开链接在线转换，进行链接转化

image-20201118163651684.png

复制真实地址，在新标签页打开

image-20201118163834342.png

再右键复制所需文件的链接

image-20201118163928932.png

这时就可以使用wget进行下载了

wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/samples/GSM3930nnn/GSM3930268/suppl/GSM3930268_FHC-2_hic_allValidPairs.txt.gz