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利用BiocManager安装R包

利用BiocManager安装R包

作者: R语言数据分析指南 | 来源:发表于2020-06-20 09:26 被阅读0次

    1.首先安装BiocManager包
    如果你的R版本为3.6版本,请将版本号设置为version = "3.11"
    version = "3.12"适用于R 4.0.0

    if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
        install.packages("BiocManager")
    BiocManager::install(version = "3.12")
    
    library("BiocManager")
    

    2.通过BiocManager安装我们常用的R包

    BiocManager::install("ggplot2")
    BiocManager::install(c("ggplot2","ggtree","DESeq2"))
    #一次安装多个包
    source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
    BiocInstaller::biocLite(c("GenomicFeatures", "AnnotationDbi"))
    #安装特定的包

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